Maladies infectieuses

Les maladies infectieuses émergent à la suite de changements dans leur aire géographique, de la « propagation interespèce » et de « l’émergence adaptative ». Il y a propagation interespèce lorsque certains changements environnementaux ou socioéconomiques permettent à un agent zoopathogène déjà transmissible à l’humain d’entrer en contact avec celui-ci (p. ex., virus Nipah). L’émergence adaptative est imputable à un changement génétique dans un micro-organisme infectant les animaux, habituellement des espèces sauvages, de sorte qu’il devient transmissible à l’humain (c.-à-d. qu’il devient une zoonose) et possiblement transmissible entre les humains (p. ex., SARS-CoV) (Ogden et coll., 2017).

Il y a de multiples facteurs d’émergence des maladies, notamment ceux qui sont associés à la mondialisation et à l’environnement. Ces derniers comprennent notamment les changements climatiques, les changements sociaux et démographiques, et les changements sur le plan des systèmes et des politiques de santé publique (Semenza et coll., 2016). Ces mêmes facteurs peuvent être responsables de la réémergence des maladies endémiques (c.-à-d. l’accroissement de leur incidence ou leur réapparition sous forme d’épidémies). Les changements climatiques peuvent avoir une incidence directe sur l’émergence et la réémergence des maladies infectieuses en raison des effets sur la survie des agents pathogènes, des taux de survie et de reproduction des arthropodes vecteurs (p. ex., moustiques, tiques, puces) et, dans le cas des zoonoses, des effets sur l’abondance des hôtes animaux. Ces facteurs déterminent le potentiel de propagation d’un agent pathogène chez les humains ou, dans le cas des zoonoses, chez les hôtes animaux; ce potentiel est représenté par le taux de reproduction de base R₀. Si R₀ est égal ou supérieur à un (ce qui signifie qu’une infection entraîne au moins une autre infection), l’agent pathogène peut persister et se propager, mais s’il est inférieur à un, il disparaîtra (Anderson et May, 1991). Les effets directs des changements climatiques qui provoquent l’émergence de la maladie à un endroit particulier sont en fait ceux qui font passer la valeur R₀ de moins de un ou un et plus à cet endroit.

Les changements climatiques peuvent avoir des impacts indirects sur l’émergence et la réémergence des maladies, en influant sur d’autres changements environnementaux et sociaux et en réduisant la capacité d’intervention des systèmes de santé publique (p. ex., les événements météorologiques extrêmes peuvent perturber la capacité de la santé publique à contrôler les éclosions de maladies). Les effets des changements climatiques sur les écosystèmes, y compris sur la biodiversité, peuvent modifier les aléas posés par les zoonoses par des effets complexes sur les communautés d’espèces sauvages (Altizer et coll., 2013; Cable et coll., 2017). D’autres changements susceptibles d’avoir une incidence sur l’émergence et la réémergence peuvent être liés aux initiatives de santé publique en matière d’adaptation qui visent à réduire les risques plus généraux pour la santé liés aux changements climatiques. Par exemple, les efforts visant à réduire les îlots de chaleur dans les zones urbaines par le virage écologique des villes (Beaudoin et Gosselin, 2016) et les mesures de gestion des inondations (voir le chapitre 3 : Aléas naturels) peuvent accroître les risques de zoonoses causées par la faune et l’incidence des maladies à transmission vectorielle (Medlock et Vaux, 2011; Millins et coll., 2017). L’utilisation accrue de la climatisation pour lutter contre la chaleur urbaine pourrait accroître les risques de légionellose (Fitzhenry et coll., 2017).

Les changements climatiques peuvent avoir des impacts négatifs sur les économies, particulièrement celles des pays à revenu faible ou intermédiaire, qui pourraient directement ou indirectement, en raison d’une fréquence accrue des conflits, nuire à la lutte contre les maladies infectieuses et contribuer à l’intensification de la densité des agents infectieux (Ogden, 2017). Les impacts économiques et les déplacements de populations peuvent simultanément entraîner une augmentation de la migration économique ou de l’arrivée de réfugiés, et donc l’importation de maladies infectieuses au Canada en provenance de l’étranger (Ogden, 2017). En outre, si les systèmes de santé ne sont pas résilients face aux changements climatiques (p. ex., résilients aux pannes d’électricité et de systèmes de communication associées aux événements météorologiques extrêmes; voir le chapitre 10 : Adaptation et résilience des systèmes de santé), les changements climatiques pourraient avoir un impact sur la capacité de repérer les maladies infectieuses émergentes ou réémergentes et d’y réagir (Mayhew et Hanefeld, 2014; Ebi et coll., 2018; Commission mondiale sur l’adaptation, 2019). La gamme de changements climatiques prévus comprend les changements à long terme dans les régimes de température et de précipitations, l’accroissement de la variabilité du climat et la fréquence accrue des événements météorologiques extrêmes, qui variera selon la région géographique du Canada (Bush et Lemmen, 2019). Ces changements auront une incidence directe et indirecte sur différents risques de maladies infectieuses de façon idiosyncratique (Ogden et Lindsay, 2016).

Depuis 2008, il y a eu six évaluations nationales, régionales ou internationales des impacts des changements climatiques sur les risques de maladies infectieuses et la vulnérabilité à cet égard (tableau 6.1). Deux évaluations canadiennes ont été réalisées : une portait sur la santé, en 2008 (Charron et coll., 2008), et l’autre, sur la santé dans un rapport plus général du gouvernement du Canada sur les impacts des changements climatiques et l’adaptation à ces changements, en 2014 (Berry et coll., 2014a). Les évaluations internationales pertinentes pour le Canada comprenaient des chapitres sur la santé et sur l’Amérique du Nord du Groupe d’experts intergouvernemental sur l’évolution du climat (GIEC) (Romero-Lankao et coll., 2014; Smith et coll., 2014) et des évaluations nationales menées aux États-Unis (Beard et coll., 2016; Ebi et coll., 2018).

Toutes les évaluations ont déterminé que les maladies transmises par les arthropodes (tels que les moustiques, les tiques et les puces) sont les plus sensibles au climat, et que celui-ci détermine leur occurrence et leur abondance par ses effets sur la survie et la reproduction des vecteurs et sur le développement d’agents pathogènes dans certains vecteurs. Les évaluations semblent indiquer que le réchauffement climatique est susceptible d’accroître les risques associés à ces maladies, mais la plupart ont indiqué une confiance modérée dans la capacité de déterminer les maladies à transmission vectorielle qui seront touchées et l’ampleur des effets. Cela s’explique par la complexité des cycles de transmission des maladies à transmission vectorielle. De multiples déterminants non climatiques, dont les changements environnementaux et ceux liés à l’aménagement du territoire, en particulier pour les zoonoses à transmission vectorielle comme le virus du Nil occidental (VNO) et la maladie de Lyme, et les mesures de contrôle, surtout pour les maladies exotiques transmises par les moustiques comme le paludisme et la dengue, sont importants pour déterminer l’occurrence et l’abondance des vecteurs et des agents pathogènes. Des évaluations antérieures ont mis en évidence l’incidence du climat sur la sensibilité aux aléas endémiques au Canada et aux États-Unis, y compris la peste et les infections à hantavirus transmise par des rongeurs, la maladie de Lyme et d’autres maladies transmises par les tiques, comme la fièvre pourprée des montagnes Rocheuses (FPMR), et les maladies transmises par les moustiques, comme le VNO, le virus de l’encéphalite équine de l’Est (VEEE) et les virus du sérogroupe de la Californie. Les évaluations ont révélé qu’il est fort probable que les changements climatiques modifient les aires géographiques et la durée des saisons de transmission (Charron et coll., 2008; Berry et coll., 2014a; Smith et coll., 2014; Beard et coll., 2016; Ebi et coll., 2018). La figure 6.2 illustre les voies par lesquelles les changements climatiques peuvent avoir une incidence sur les risques de maladies infectieuses au Canada, selon des évaluations antérieures.

L’évaluation canadienne de 2008 a fourni des projections fondées sur un modèle de la propagation de la maladie de Lyme vers le nord, c’est-à-dire des États-Unis au Canada, en raison de l’expansion de l’aire de répartition du vecteur de la tique Ixodes scapularis causée par les changements climatiques (Charron et coll., 2008). La propagation de la tique le long des trajectoires déterminées par le climat et l’émergence de la maladie de Lyme au Canada ont depuis été documentées (Berry et coll., 2014a; Smith et coll., 2014; Beard et coll., 2016; Ebi et coll., 2018) (tableau 6.1). Ces mêmes évaluations ont également permis d’évaluer les risques d’introduction de maladies exotiques à transmission vectorielle, telles que le paludisme, la dengue et le virus chikungunya, associés aux changements climatiques. Les températures à la hausse devraient accroître l’étendue des zones géographiques de l’Amérique du Nord propices à la transmission d’agents pathogènes par des vecteurs exotiques et à la survie des vecteurs de maladie des moustiques exotiques (p. ex., espèces d’Aedes).

L’adaptation aux maladies infectieuses liées au climat passe d’abord par l’évaluation des risques pour la santé et la détermination des populations plus vulnérables à leurs impacts. Il convient d’évaluer la capacité des systèmes de santé publique à déceler les maladies infectieuses émergentes et réémergentes en exerçant surveillance, et de prévenir et contrôler celles-ci grâce à la promotion de la santé ou la prise de mesures plus proactives (p. ex., au point de vaccins), de même que la capacité des systèmes de soins de santé à réduire au minimum les conséquences des maladies infectieuses. Les évaluations fournissent des renseignements sur la vulnérabilité aux maladies infectieuses et déterminent les mesures les plus efficaces pour la réduire (Berry, 2008). De façon générale, des évaluations antérieures ont indiqué qu’en Amérique du Nord, la capacité des systèmes de santé publique d’évaluer les risques liés aux maladies infectieuses émergentes et réémergentes et de les déceler, de les prévenir et de les contrôler est robuste (voir le tableau 6.1). Le risque pour la plupart des Canadiens et des Canadiennes est faible en raison du statut socioéconomique relativement élevé d’une grande proportion de la population qui évolue dans un milieu qui limite de nombreux risques de maladie, et en raison de la robustesse des infrastructures et des systèmes de soins de santé et de santé publique. En outre, des progrès ont été réalisés pour combler les lacunes en matière de connaissances, de surveillance, de capacité et de système d’alerte précoce relevées dans les évaluations précédentes (voir la section 6.4 Adaptation en vue de réduire les risques pour la santé).

6.3.1.1 Effets des changements climatiques sur l’écologie et l’épidémiologie des vecteurs et sur la transmission des maladies à transmission vectorielle

Les cycles de vie de nombreux arthropodes vecteurs et les impacts des conditions météorologiques et climatiques sur ces cycles de vie ont été étudiés de manière intensive en laboratoire, sur le terrain et par des études de modélisation, et sont examinés ailleurs (Ogden et Lindsay, 2016). La façon dont les changements climatiques et météorologiques peuvent avoir une incidence sur les arthropodes vecteurs et la transmission des maladies à transmission vectorielles est résumée dans l’encadré 6.1. Bien que les effets des conditions météorologiques et climatiques soient les mêmes pour les arthropodes vecteurs, la façon dont ils touchent expressément les cycles de vie et les cycles de transmission est hautement idiosyncrasique parmi les différents vecteurs et agents pathogènes (figure 6.3). Les changements climatiques peuvent avoir une incidence sur le risque de maladies à transmission vectorielle en modifiant les facteurs de risque liés au comportement social comme la perception du risque et l’adoption de comportements préventifs (Bouchard et coll., 2018). La croissance démographique, les déplacements et des facteurs sociaux et économiques (p. ex., changement de l’exposition au virus de l’encéphalite à tiques en Europe de l’Est en raison de l’évolution de l’exposition de la population à la suite de l’effondrement du bloc communiste) ont également été associés à des taux différentiels d’exposition humaine aux vecteurs et aux maladies à transmission vectorielle (Randolph, 2004). La façon dont les changements climatiques peuvent avoir une incidence indirecte sur les risques en raison de ces facteurs doit faire l’objet d’une étude plus approfondie.

6.3.1.2 Maladies exotiques transmises par les moustiques

Il y a un vaste éventail de maladies transmises par les moustiques qui ont une incidence sur la santé publique à l’échelle mondiale. Certaines, comme le paludisme, la dengue, la fièvre jaune et le chikungunya, qui sont transmis de personne à personne par les moustiques, figurent parmi les plus grandes menaces à la santé publique au monde, avec des millions de cas et de décès chaque année (OMS, 2019a). D’autres maladies, dont bon nombre sont des zoonoses transmises par les moustiques comme celles causées par et les virus de l’encéphalite équine du Sindbis et du Venezuela, surviennent de façon plus sporadique (tableau 6.2). Les maladies exotiques transmises par les moustiques ne sont pas établies au Canada en raison de nombreux facteurs, dont le climat. Dans le cas de la plupart des maladies exotiques transmises par des moustiques, le climat du Canada est actuellement trop froid pour les vecteurs ou pour le développement des agents pathogènes chez le moustique (Ng et coll., 2019). D’autres obstacles existent, notamment l’absence d’hôtes animaux pour certaines maladies (comme les primates pour le virus de la fièvre jaune), les normes en matière de logement, notamment les portes et les fenêtres qui empêchent l’entrée des vecteurs et les systèmes de climatisation, qui inhibent la transmission d’une personne à une autre par les moustiques (Reiter, 2001). Les barrières physiques doivent être surmontées pour que les agents pathogènes et les vecteurs soient transportés ici depuis l’étranger.

L’expansion de la dispersion géographique des maladies exotiques à transmission vectorielle au Canada exige l’introduction de vecteurs et d’agents pathogènes exotiques en provenance des pays où ils sont endémiques. On s’attend à ce que l’augmentation du commerce et des déplacements à l’échelle mondiale facilite la migration internationale des moustiques vecteurs (infectés ou non) et des voyageurs infectés, accroissant ainsi la possibilité d’introduire des vecteurs et des agents pathogènes dans des régions où ils étaient absents auparavant (Tatem et coll., 2006; Tatem et coll., 2012; Semenza et coll., 2016). Il y a trois scénarios d’introduction d’agents pathogènes exotiques à transmission vectorielle au Canada (encadré 6.2).

L’impact des changements climatiques sur la santé publique variera selon le scénario d’émergence et pourrait accroître la possibilité que les Canadiens et les Canadiennes contractent une infection lors d’un voyage à l’étranger, que la transmission autochtone soit de courte durée (c.-à-d. locale, confinée au Canada) lorsque des vecteurs compétents sont déjà établis au Canada, et qu’il y ait endémicité permanente de nouvelles maladies (Ng et coll., 2019).

Les vecteurs de maladies exotiques transmises par les moustiques sont sensibles aux conditions météorologiques, lesquelles devraient être touchées par les changements climatiques. Des expériences sur le terrain et en laboratoire démontrent la sensibilité à la température des moustiques des espèces Aedes et Anopheles, qui sont les principaux vecteurs des maladies exotiques les plus graves à l’échelle mondiale (Brady et coll., 2013; Shapiro et coll., 2017). En général, des températures plus chaudes, un taux d’humidité élevé et une augmentation des précipitations facilitent le cycle de vie des moustiques en soutenant le développement et la survie des larves et en prolongeant la durée de vie des adultes (Reeves et coll., 1994; Jetten et Focks, 1997; Paaijmans et coll., 2009; Yang et coll., 2009). Ces conditions climatiques influeront sur la transmission des agents pathogènes de la façon suivante :

• Réduction du temps de développement des œufs chez les moustiques femelles adultes, diminuant ainsi le temps entre les repas de sang et accroissant leur fréquence
• Raccourcissement de la période d’incubation extrinsèque (PIE), ce qui permet aux moustiques de devenir infectieux plus rapidement (Davis, 1932; Reeves et coll., 1994; Jetten et Focks, 1997; Paaijmans et coll., 2009; Paaijmans et coll., 2013; Xiao et coll., 2014)
• Augmentation de la longévité des moustiques, permettant aux moustiques infectieux de piquer un plus grand nombre de personnes (Yang et coll., 2009)

Toutefois, bon nombre de ces relations dépendantes des conditions météorologiques sont complexes; les relations peuvent être non linéaires, peuvent avoir des effets opposés selon les circonstances et peuvent être influencées par des facteurs non climatiques (encadré 6.1).

La mesure dans laquelle les changements climatiques auront ou ont déjà eu un effet sur la répartition mondiale de nombreux moustiques et maladies transmises par les moustiques est incertaine. En effet, la relation entre le climat et les maladies à transmission vectorielle, en particulier celles transmises de personne à personne par les moustiques, est complexe, et la répartition spatiotemporelle des vecteurs et des agents pathogènes qu’ils transportent dépend d’une série de facteurs qui ne sont pas directement liés au climat. Ces facteurs comprennent : la mobilité accrue et l’interconnectivité des personnes et des biens (Junxiong et Yee-Sin, 2015; Semenza et coll., 2016; Tabachnick, 2016; Lindsey et coll., 2018; Romeo-Aznar et coll., 2018); l’urbanisation et d’autres changements dans l’aménagement du territoire (Junxiong et Yee-Sin, 2015; Jones et O’Neill, 2016; Semenza et coll., 2016; Asad et Carpenter, 2018; Romeo-Aznar et coll., 2018); les facteurs socioéconomiques (KC et Lutz, 2017; Reina Ortiz et coll., 2017; Lindsey et coll., 2018; Moreno-Madriñán et Turell, 2018; Romeo-Aznar et coll., 2018); les changements démographiques, y compris ceux imputables à l’immigration et à la croissance démographique (Asad et Carpenter, 2018; Lindsey et coll., 2018; Romeo-Aznar et coll., 2018); l’immunité de la population (Anyamba et coll., 2012; Larrieu et coll., 2014; Semenza et coll., 2016); l’évolution et l’adaptation génétiques (Gubler, 2007; Tsetsarkin et coll., 2007; Tabachnick, 2016); l’accès aux soins de santé (Reiter, 2008; Ooi et Gubler, 2009; Semenza et coll., 2016); et les programmes de lutte et d’intervention contre les vecteurs (Githeko et coll., 2000; Junxiong et Yee-Sin, 2015; Tasanee et coll., 2015). Les changements climatiques n’ont aucune incidence sur certains de ces facteurs, mais peuvent avoir un effet sur d’autres et, par le fait même, avoir des répercussions indirectes sur les maladies transmises par les moustiques.

Malgré l’incertitude, il est probable que les changements climatiques auront des effets sur la propagation des moustiques et des maladies transmises par les moustiques (confiance élevée), et il y aura des variations régionales partout dans le monde (Smith et coll., 2014). En raccourcissant la durée du cycle de vie, en prolongeant la survie des moustiques et en améliorant la transmission des agents pathogènes, les changements climatiques favoriseront l’expansion des populations de moustiques et d’agents pathogènes transmis par les moustiques à certains endroits et élargiront la répartition géographique de leurs niches écologiques dans de nombreux cas, principalement en direction du pôle et en altitude (Campbell et coll., 2015; Kraemer et coll., 2015; Samy et coll., 2016; Hertig, 2019; Kamal et coll., 2019; Kraemer et coll., 2019). Bien que les populations de moustiques puissent étendre leur territoire à de nouvelles régions géographiques, elles peuvent disparaître dans d’autres régions (Machado-Machado, 2012; Escobar et coll., 2016; Williams et coll., 2016).

On s’attend à ce que le réchauffement climatique augmente l’abondance des populations d’espèces de moustiques endémiques au Canada (Hongoh et coll., 2012) et améliore les conditions de transmission des agents pathogènes, ce qui créera un environnement plus propice à l’émergence de nouvelles maladies transmises par les moustiques selon les scénarios 1 et 2, surtout dans le sud du Canada (encadré 6.2). De plus, les conditions de température dans certaines parties du sud du Canada devraient devenir de plus en plus favorables pour les populations de moustiques Ae. aegypti et Ae. albopictus (moustique tigre), qui sont des vecteurs de la dengue, du chikungunya, du Zika et de la fièvre jaune. Les changements climatiques devraient faire en sorte que les températures se prêtent davantage à la transmission de virus (Ng et coll., 2017), accroissant ainsi la possibilité que l’émergence de maladies transmises par les moustiques selon le scénario 3 (encadré 6.2) se produise dans le sud du Canada. On anticipe que les conditions climatiques de la côte sud de la Colombie-Britannique ainsi que du Québec, du Nouveau-Brunswick, de la Nouvelle-Écosse et du sud de l’Ontario, deviennent adaptées sur le plan climatique pour l’espèce Ae. albopictus (Ogden et coll., 2014a). Les conditions climatiques de la côte sud de la Colombie-Britannique pourraient également devenir adaptées pour l’espèce Ae. aegypti (Campbell et coll., 2015; Kamal et coll., 2019). En 2016, un spécimen d’Ae. aegypti adulte a été collecté dans le sud de l’Ontario. Un très petit nombre d’adultes et de larves ont été trouvés au cours de l’année suivante dans le cadre du piégeage des moustiques et d’une surveillance accrue sur le terrain dans la région, ce qui porte à croire que cette espèce n’est pas établie au Canada (Windsor-Essex County Health Unit, 2019a). Cependant, l’espèce Ae. albopictus a été observée de façon sporadique dans plusieurs endroits précis du sud de l’Ontario depuis 2005. Il y a une petite région du Canada où le moustique Ae. albopictus s’est établi entre 2017 et 2018. Toutefois, à ce jour, rien n’indique que ces moustiques sont porteurs d’agents pathogènes pouvant provoquer des maladies chez les humains (Windsor-Essex County Health Unit, 2019b).

La probabilité d’émergence de nouvelles maladies à transmission vectorielle au Canada, pour les scénarios d’émergence 2 et 3, dépendra du nombre d’événements d’introduction d’agents pathogènes ou de vecteurs, ainsi que de la mesure dans laquelle les changements climatiques font du Canada un environnement plus propice à leur établissement. Certaines formes de déplacements mondiaux peuvent être imputables aux changements climatiques, par exemple, les réfugiés climatiques (McMichael et coll., 2012) et les changements dans les habitudes de voyage (Organisation mondiale du tourisme et Programme des Nations Unies pour l’environnement, 2008). Les changements climatiques peuvent donc avoir trois impacts qui accroissent la probabilité d’émergence selon les scénarios 2 et 3 :

• Conditions climatiques plus favorables à la transmission au Canada
• Augmentation de l’abondance d’agents pathogènes exotiques et de leurs vecteurs dans les pays autres que le Canada
• Introduction accrue d’agents pathogènes et de vecteurs

Même sans les effets des changements climatiques, l’interconnectivité mondiale augmente (Findlater et Bogoch, 2018) et les Canadiens et les Canadiennes sont des voyageurs enthousiastes (Statistique Canada, 2019). Les déplacements locaux et mondiaux continueront donc de présenter un risque croissant d’introduction au Canada d’agents pathogènes exotiques par l’intermédiaire de vecteurs importés et d’humains infectés. Les voies d’introduction peuvent toutefois être prévisibles. Dans le cas du virus de l’encéphalite japonaise (VEJ), le scénario le plus probable d’introduction aux États-Unis serait l’arrivée de moustiques femelles infectés par le VEJ à bord d’avions en provenance de l’est de la Chine (Oliveira et coll., 2018). L’introduction du VEJ suivrait probablement une voie similaire vers le Canada, la côte de la Colombie-Britannique étant peut-être le lieu d’entrée le plus probable en raison d’une forte connectivité avec l’Asie sur le plan des voyages et du commerce. Cette région jouit également d’un climat tempéré et les réservoirs et moustiques vecteurs endémiques qui pourraient soutenir la transmission locale du VEJ, s’il est introduit, y sont établis.

Outre un climat propice, d’autres facteurs tels que la pauvreté et le manque d’accès aux infrastructures, aux soins de santé et aux mesures de lutte contre les maladies sont également importants pour la transmission endémique des agents pathogènes exotiques transmis de personne à personne par les moustiques (Ebi et coll., 2006a; Halstead, 2008). Les conditions sociales de la majeure partie de la population canadienne (en particulier la densité démographique et les conditions de logement) devraient limiter les taux de piqûres de moustiques, et les services de santé retirent les personnes infectées de la chaîne de transmission, ce qui fait qu’il est plus difficile pour ces agents pathogènes exotiques d’établir des cycles de transmission efficaces et soutenus (Berrang-Ford et coll., 2009; Ng et coll. 2019). Il est plus probable que l’impact sur la santé publique se fera sentir dans des cas autochtones occasionnels chez des Canadiens et des Canadiennes qui n’ont pas voyagé. Ceci pourrait avoir de graves conséquences pour la santé parce que le diagnostic peut être retardé en l’absence d’antécédents de voyage (Berrang-Ford et coll., 2009; Ng et coll., 2019). Un diagnostic tardif de cas « inattendus » de maladies exotiques transmises par les moustiques chez la population canadienne pourrait déboucher sur quelques chaînes de transmission et des éclosions limitées. Parmi les exemples provenant de l’extérieur du Canada, mentionnons l’introduction du virus du chikungunya en Europe méditerranéenne en 2007 et de la dengue en France, en Croatie et à Madère entre 2010 et 2013. Ces événements pourraient avoir été imputables à des conditions météorologiques particulièrement chaudes (Rezza et coll., 2007; Tomasello et Schlagenhauf, 2013).

En revanche, si les zoonoses exotiques transmises par les moustiques sont introduites, elles risquent davantage de devenir endémiques si les conditions environnementales, y compris le climat, sont favorables, car la transmission d’agents pathogènes parmi les hôtes réservoirs chez les animaux sauvages ou les animaux d’élevage ne serait pas grandement limitée, comme ce fut le cas pour le VNO. L’expansion de l’aire de répartition du virus Sindbis (VSIN) et du virus Usutu (VUSU), à l’extérieur de l’Afrique et en Europe, a fortement ressemblé à celle du VNO en Amérique du Nord (Weissenböck et coll., 2002; Ashraf et coll., 2015). Étant donné que les moustiques vecteurs et les réservoirs du VUSU et du VSIN sont déjà présents au Canada et que le climat dans les régions envahies de l’Europe est très semblable à celui des régions du sud du Canada, l’émergence du VSIN ou du VUSU en tant que virus endémiques est possible dans ce pays. Les infections par le VSIN et le VUSU produisent des infections désagréables, mais relativement bénignes chez les humains immunocompétents.

Une autre zoonose exotique transmise par les moustiques, le virus de la fièvre de la vallée Rift (VFVR), peut causer des infections graves et mortelles (OMS, 2019b), de sorte que la possibilité d’émergence de ce virus au Canada est une menace plus préoccupante. Il a été démontré que les espèces de moustiques endémiques au Canada sont des vecteurs compétents pour le VFVR, alors qu’un large éventail d’espèces sauvages et de bétail domestiqué sont des réservoirs animaux (encadré 6.2, tableau 6.2). On estime que le mécanisme d’introduction le plus probable en Amérique du Nord est celui des personnes infectées par le VFVR qui arrivent à bord d’un avion en provenance des zones endémiques touchées par une éclosion (Golnar et coll., 2014; Golnar et coll., 2018). Si le voyageur entre en contact avec des moustiques vecteurs endémiques, la transmission aux espèces sauvages et au bétail peut engendrer de l’endémicité.

6.3.1.3 Maladies endémiques transmissibles par les moustiques au Canada

Les quatre arbovirus les plus importants sur le plan médical qui sont endémiques au Canada, soit le VNO, le VEEE, le virus de Jamestown Canyon (VJC) et le virus snowshoe hare (VSSH), sont transmis par des piqûres de moustiques femelles infectées. Les moustiques contractent les agents pathogènes d’hôtes réservoirs mammifères ou aviaires précis. Les principaux vecteurs du VNO sont Cx. pipiens et Cx. restuans dans l’est du Canada et Cx. tarsalis dans l’ouest (Kramer et coll., 2008), tandis que Culiseta melanura est le principal vecteur du VEEE (Armstrong et Andreadis, 2010). Les espèces de moustiques de catégories autres que Culex (p. ex., les espèces Aedes, Culiseta et Anopheles) sont les principaux vecteurs des virus du sérogroupe Californie (VSGC) comme le VSSH et le VJC (Drebot, 2015; Pastula et coll., 2015; Webster et coll., 2017). Pour ce qui est du VNO et du VEEE, un large éventail d’espèces d’oiseaux servent de réservoirs, y compris les corvidés et les passereaux (Kilpatrick et coll., 2006; Kramer et coll., 2008; Ludwig et coll., 2010; Reisen, 2013). Le principal réservoir du VJC est le cerf de Virginie (Andreadis et coll., 2008), tandis que les écureuils, les tamias et les lièvres sont les hôtes réservoirs du VSSH (Drebot, 2015). Un certain nombre de ces agents pathogènes peuvent aussi être transférés par transmission ovarienne, ce qui permet de moins dépendre des réservoirs des mammifères (Griot et coll., 1993).

D’autres agents viraux et bactériens transmis par les insectes sont également endémiques au Canada, mais ils sont moins actifs, ou leur présence est sous-étudiée. La prévalence du virus de l’encéphalite équine de l’Ouest semble avoir diminué au Canada au cours des dernières décennies, tandis que le virus de Cache Valley (VCV) a été responsable d’un certain nombre d’éclosions chez le bétail (c.-à-d. le mouton) en Ontario, au Québec et dans d’autres provinces, mais les cas d’infection chez l’humain sont probablement sous-déclarés (Drebot, 2015). Les arbovirus peuvent aussi parfois être transmis à la suite d’une transfusion sanguine ou d’une greffe de tissus (Fonseca et coll., 2005; Direction de la règlementation des agents pathogènes, 2010). Hormis cette possibilité, les humains sont des hôtes accidentels ou « terminaux » des arbovirus transmis par des moustiques, ce qui signifie que, bien qu’ils puissent être infectés, ils ne peuvent pas transmettre ces virus efficacement aux moustiques qui se nourrissent de leur sang en raison d’une virémie faible et transitoire ou d’une charge virale faible (Kramer et coll., 2008; Kulkarni et coll., 2015).

Environ 20 % des personnes exposées à des virus transmis par les moustiques, comme le VNO, le VEEE, le VJC ou le VSSH, développeront une maladie clinique aiguë dont les symptômes sont, notamment, la fièvre, des maux de tête, des éruptions cutanées, des nausées et des douleurs musculaires. La plupart des personnes infectées se rétablissent complètement, mais environ 1 % d’entre elles développent une maladie grave (p. ex., méningite, encéphalite, paralysie flasque aiguë et poliomyélite) causant des déficits neurologiques et cognitifs qui peuvent être prolongés ou permanents. Environ 10 % des cas graves sont mortels. La maladie peut frapper plus gravement les personnes de plus de 70 ans et celles qui ont des problèmes médicaux sous-jacents, comme l’obésité, le diabète, l’hypertension et les maladies du cœur. Cependant, le VSSH cause aussi des maladies neurologiques chez les enfants. Les personnes immunodéprimées sont aussi plus à risque (Petersen et coll., 2013a; Petersen et coll., 2013b; Sejvar, 2014; Badawi et coll., 2018). La gravité de la maladie varie et dépend du virus. Par exemple, le VEEE est l’une des maladies transmises par les moustiques les plus graves aux États-Unis, avec un taux de mortalité d’environ 33 % chez les personnes développant une maladie neurologique et des dommages cérébraux importants chez la plupart des survivants qui ont développé une maladie symptomatique (Centers for Disease Control and Prevention, 2018c). Le virus de l’encéphalite équine de l’Ouest et le VCV donnent lieu à une gamme similaire de symptômes — la majorité des cas sont asymptomatiques, mais, pour un pourcentage variable d’entre eux, l’infection se manifeste par une encéphalite, une méningite, une encéphalomyélite, une forte fièvre, une conscience altérée, une dysfonction neurologique, une méningite aseptique, une raideur de la nuque, des maux de tête, une myalgie, des tremblements, des nausées, des vomissements ou une infection des voies urinaires. Le taux de mortalité de l’encéphalite de Saint-Louis se situe entre 5 % et 20 %, mais on croit qu’il est beaucoup plus faible pour l’encéphalite équine de l’Ouest et l’infection par le VCV (Centers for Disease Control and Prevention, 2018d).

Les effets prévus des changements climatiques sur les maladies endémiques transmises par les moustiques au Canada sont les suivants : une expansion de l’aire de répartition vers le nord associée au réchauffement à long terme et une augmentation du comportement épidémique associée à la variabilité du climat et aux événements météorologiques extrêmes en raison de leurs effets sur la survie des vecteurs et les taux de reproduction (deux éléments qui influent sur l’abondance des vecteurs), les taux de morsure, la durée de la saison d’activité et la durée de la PIE. Les maladies endémiques transmises par les moustiques au Canada sont des zoonoses transmises par des animaux sauvages (oiseaux et mammifères). Les effets des changements climatiques sur les populations de ces animaux devraient avoir une incidence sur les cycles de transmission des agents pathogènes. Ces effets pourraient simplement entraîner une expansion de l’aire de répartition des hôtes vers le nord, mais des effets plus complexes sur la biodiversité des hôtes réservoirs peuvent se manifester. Par exemple, les changements au chapitre de l’abondance et de l’aire de répartition géographique des hôtes peuvent être limités par des conditions physiques (p. ex., obstacles au déplacement) et des processus biologiques (p. ex., réduction de l’accès aux aliments à des moments critiques du cycle de vie, comme les périodes de reproduction et d’élevage). Les changements qui en résultent dans la composition des espèces peuvent avoir des conséquences variées, comme des perturbations dans les relations prédateur-proie et hôte-parasite. Par conséquent, bien qu’il soit probable que la biodiversité des hôtes change en réponse aux nouvelles conditions climatiques, des incertitudes subsistent quant à la façon dont ces changements influeront sur le risque d’exposition des Canadiens et des Canadiennes aux maladies à transmission vectorielle (Varrin et coll., 2007). Selon toute vraisemblance, l’impact sera propre à l’écosystème ou à l’habitat, ce qui entraînera un ensemble incohérent d’augmentations et de diminutions de la biodiversité des populations hôtes, qui changera avec le temps à l’échelle du pays. Les événements météorologiques extrêmes causés par les changements climatiques, comme des sécheresses et des épisodes de chaleur, peuvent avoir des effets plus rapides sur les populations d’hôtes réservoirs en les amenant à chercher des sources d’eau dans les aires de reproduction des moustiques (Shaman et coll., 2005; Wang et coll., 2010; Harrigan et coll., 2014).

De nombreuses études de modélisation ont examiné la relation entre les variables climatiques (principalement la température et les précipitations) et l’infection par le VNO (humains, oiseaux ou moustiques infectés) au Canada (Wang et coll., 2011; Chen et coll., 2013; Tam et coll., 2014; Paz, 2015; Yoo et coll., 2016; DeFelice et coll., 2018). Toutefois, l’écologie du VEEE et des VSGC demeure sous-étudiée, probablement en raison des perceptions selon lesquelles ces virus ne sont pas aussi importants pour la santé publique, de même que du manque de données de surveillance détaillées. Cependant, on sait que la couverture terrestre, y compris la proximité et la taille de zones boisées de conifères et de terres humides, a une incidence sur la présence du VEEE et du VJC (Vander Kelen et coll., 2014; Rocheleau et coll., 2018) et qu’elle pourrait également être touchée par les changements climatiques.

L’impact des changements climatiques sur la transmission du VNO au Canada a fait l’objet de deux études qui sont parvenues aux mêmes conclusions. Chen et coll. (2013) ont examiné la transmission du VNO dans les Prairies, où Cx. tarsalis est le principal vecteur, et prévoient une prolongation de l’activité saisonnière de Cx. tarsalis infecté par le VNO, qui passerait de trois mois (c.-à-d. de juin à août) à cinq mois (c.-à-d. de mai à septembre) d’ici les années 2080. Les auteurs ont également prévu une expansion de l’aire de répartition vers le nord pour Cx. tarsalis et le VNO. Comme ce vecteur est également capable de transmettre le VCV, l’étendue et la prévalence de cette maladie peuvent également être touchées par cette expansion de Cx. tarsalis (Ayers et coll., 2018). Hongoh et coll. (2012) ont modélisé la répartition potentielle des populations de Cx. pipiens dans l’est du Canada en fonction des changements climatiques actuels et anticipés et prédisent une expansion semblable de l’aire de répartition de ce vecteur du VNO vers le nord.

Une meilleure compréhension de la façon dont les changements climatiques peuvent perturber les populations d’espèce réservoirs aviaires et mammifères permettrait une évaluation plus robuste des effets des changements climatiques, mais peu d’études ont réalisé ces évaluations en raison de données limitées et de contraintes méthodologiques. Les données actuelles indiquent que les aires de répartition (ou les enveloppes climatiques) dont le climat est adéquat pour de nombreuses espèces se déplaceront probablement vers le nord par suite du réchauffement des températures. Par exemple, les modèles de niche écologique pour 765 espèces portent à croire que les changements climatiques pourraient accroître la biodiversité dans le sud du Québec au cours de ce siècle à mesure que les espèces se déplacent vers le nord (Berteaux et coll., 2010; Chambers et coll., 2013). De même, de nombreuses espèces d’oiseaux qui nichent actuellement dans la partie nord de l’est des États-Unis sont susceptibles de se déplacer vers le nord au Canada, ce qui accroîtra la richesse des espèces d’oiseaux dans l’est du Canada (DesGranges et Morneau, 2010). La perte et la perturbation de l’habitat causées par les changements climatiques ou d’autres facteurs qui peuvent entraîner la fragmentation de l’habitat (Warren et Lemmen, 2014) peuvent avoir une incidence sur les populations des hôtes réservoirs aviaires et mammifères (Berteaux et Stenseth, 2006). La mesure dans laquelle ces effets positifs et négatifs sur les populations hôtes entraîneront une augmentation ou une réduction des risques de maladies transmises par les moustiques n’est pas encore claire et nécessite une étude plus approfondie (Salkeld et coll., 2013).

Les infections transmises par les moustiques sont signalées au Canada depuis de nombreuses décennies; toutefois, récemment, le nombre de cas d’infection à arbovirus semble augmenter (Ludwig et coll., 2019). Depuis 2002, le nombre de cas signalés chaque année de VNO chez l’humain, la seule maladie endémique transmise par les moustiques au Canada à déclaration obligatoire au pays, a fluctué considérablement au fil du temps à l’échelle nationale. Les cas signalés fluctuaient de 5 cas en 2010 à des sommets de 1 481 en 2003 (pendant l’invasion initiale au Canada) et de 2 215 cas en 2007, ce qui était associé à une abondance sans précédent de moustiques Cx. tarsalis dans les provinces des Prairies (figure 6.4). Cette augmentation pourrait être compatible avec les effets des conditions météorologiques et la variabilité du climat sur la dynamique du VNO (Ludwig et coll., 2019).

Les variations géographiques au fil du temps ont également été très prononcées. En 2003 et 2007, la plupart des cas humains de VNO ont été signalés dans les Prairies (Alberta, Saskatchewan et Manitoba), mais en 2002, 2012 et 2018, la plupart des cas déclarés ont été détectés en Ontario et au Québec. Cette variabilité est, à tout le moins, partiellement compatible avec les effets de la variabilité des conditions météorologiques locales sur l’abondance des moustiques Cx. tarsalis, Cx. pipiens et Cx. restuans pendant les années d’éclosion, et une indication qu’une variabilité plus importante des conditions météorologiques causée par les changements climatiques pourrait engendrer un comportement épidémique accru des maladies endémiques transmises par les moustiques (Ludwig et coll., 2019). Des cas humains de VSGC ont été détectés partout au Canada, et un seul cas de VEEE chez l’humain a été signalé en 2016 en Ontario (M. Drebot, communication personnelle, 2019).

La sensibilisation accrue aux VSGC, l’amélioration de la surveillance sur le terrain des hôtes réservoirs et une plus grande capacité de diagnostic chez les humains et les animaux ont possiblement contribué à leur « émergence » comme problème de santé publique pendant la saison des moustiques. Des tests diagnostiques de routine pour les VSGC étaient réalisés à la fin des années 1970 et au cours des années 1980; ils ont cependant été interrompus jusqu’à ce que de nouvelles méthodes d’essai soient introduites en 2005, lorsque des cas chez l’humain ont encore une fois été documentés au Canada. De 2005 à 2014, plus de 200 cas probables et confirmés d’infections et d’expositions au VSGC ont été dépistés par une surveillance en laboratoire, la maladie causée par le VJC étant détectée plus souvent que celle causée par le VSSH (Drebot, 2015; Lau et coll., 2017; Webster et coll., 2017; M. Drebot, communication personnelle, 2019). Bien que la déclaration des infections par le VSGC ne soit pas obligatoire à l’échelle nationale, le nombre d’infections par ce virus est mentionné dans les rapports annuels sur les arbovirus de l’Agence de la santé publique du Canada (gouvernement du Canada, 2019a) et varie de 34 à 122 cas par année. À ce jour, aucun lien direct n’a été observé entre les effets de la variabilité des conditions météorologiques ou des changements climatiques récents et l’incidence de ces virus transmis par les moustiques au Canada, bien qu’un tel lien puisse exister.

Au Canada, des changements ont été observés au chapitre de la répartition géographique et de la densité des moustiques vecteurs. La faune de moustiques du Canada, qui comprend 74 espèces de moustiques de 10 genres différents, a été décrite dans les années 1970 (Wood et coll., 1979). Depuis, six espèces (Ochlerotatus ventrovittis, Oc. japonicus, Culex salinarius, Cx. erraticus, Anopheles perplexens et An. crucians) ont été déclarées comme étant peut-être nouvellement établies au Canada (Thielman et Hunter, 2007; Giordano et coll., 2015; Iranpour et coll., 2017). De plus, l’aire de répartition géographique de dix espèces (Uranotaenia sapphirina, Culiseta melanura, Cs. minnesotae, Culex tarsalis, Ochlerotatus sticticus, Oc. spencerii, Oc. dorsalis, Oc. nigromaculis, Oc. campestris et Oc. cataphylla) a pris de l’expansion au Canada (Iranpour et coll., 2009). Il est possible que certaines de ces expansions de l’aire de répartition, lesquelles peuvent avoir une incidence sur la santé publique, aient été facilitées par les changements climatiques; toutefois, le manque de surveillance systématique ne permet pas de conclure à un tel lien.

Il y a de solides données d’observation qui étayent des changements au chapitre de l’aire de répartition des espèces de mammifères et d’oiseaux en Amérique du Nord. Au cours des 40 dernières années, environ 180 des 305 espèces d’oiseaux hivernant en Amérique du Nord ont étendu leur aire de répartition vers le nord à un rythme moyen de 1,4 km par année. De même, les aires de reproduction des oiseaux dans le sud de l’Amérique du Nord se sont déplacées de 2,4 km par année en moyenne (gouvernements fédéral, provinciaux et territoriaux du Canada, 2010). Dans les forêts du nord-est de l’Amérique du Nord, 27 des 38 espèces dont l’aire de répartition historique est documentée ont étendu leur aire de répartition, principalement vers le nord (Rodenhouse et coll., 2009). Une évolution de l’aire de répartition au Canada a été recensée pour un certain nombre d’espèces (Hitch et Leberg, 2007; Blancher et coll., 2008;), et des analyses détaillées ont été réalisées pour certaines espèces, notamment la paruline à capuchon (Setophaga citrina) (Melles et coll., 2011) et le petit polatouche (Glaucomys volans) (Garroway et coll., 2010; Garroway et coll., 2011). Il est très possible que les déplacements géographiques de ces espèces soient en partie attribuables au réchauffement climatique récent. De tels changements dans l’aire de répartition pourraient avoir une incidence sur la transmission par les moustiques des agents pathogènes endémiques en modifiant l’aire de répartition des espèces réservoirs, tandis que les espèces qui ne sont pas des réservoirs pourraient « diluer » les cycles de transmission des arbovirus (Levine et coll., 2017). Cependant, d’autres études sont nécessaires pour comprendre précisément comment, où et quand cela peut avoir un impact sur les risques pour les humains.

6.3.1.4 Autres zoonoses transmises par les insectes

Les changements climatiques peuvent également avoir un impact sur d’autres zoonoses transmises par les insectes. Des cas de peste, causée par la bactérie Yersinia pestis, ont été documentés sporadiquement dans l’ouest du Canada. Cette bactérie se transmet par la morsure d’une puce infectée ou par contact direct avec des tissus ou des liquides infectieux lors de la manipulation d’un animal ou d’un être humain qui a contracté la maladie ou qui est décédé des suites de celle-ci. La peste pneumonique peut également être transmise par les gouttelettes produites par la toux ou les éternuements d’un animal ou d’un humain infecté (Centers for Disease Control and Protection, 2019a). Les personnes infectées par la peste développent habituellement des symptômes assimilables à ceux de la grippe. Après cette phase grippale, ils développent des symptômes variables selon la forme de peste – bubonique, septicémique (cette forme se développe généralement comme une complication de la peste bubonique) ou pneumonique. La peste est une infection qui nécessite des soins médicaux d’urgence, car les taux de mortalité sont élevés en l’absence de traitement (Centers for Disease Control and Protection, 2019a). Les réservoirs naturels de Y. pestis sont des rongeurs sauvages, en particulier des spermophiles en Amérique du Nord, et des gerbilles en Asie.

Il y a un lien bien connu entre les régimes climatiques (généralement les périodes plus chaudes et plus humides) et le passage interespèce de la peste des cycles de transmission gerbilles-puces aux humains en Asie centrale en raison des effets sur la végétation qui favorisent les populations de gerbilles et, ensuite, les populations de puces (Kausrud et coll., 2010; Samia et coll., 2011). On pense que ces événements de passage interespèce en Asie ont été la source des grandes pandémies de peste (peste de Justinien, Peste noire) qui ont décimé les populations humaines en Europe (Kausrud et coll., 2010). L’impact du climat a été étudié sur les épidémies de peste dans l’Europe préindustrielle (1347-1760 après J.-C). Contrairement au passage interespèce dans les steppes asiatiques, les résultats semblent indiquer que la peste en Europe était associée à des climats plus secs et plus froids (Yue et Lee, 2018). Cette différence est probablement imputable au fait que la transmission en Europe est due à une combinaison de transmission directe de personne à personne (provoquant une peste de type pneumonique chez l’humain) et de transmission par les puces à partir de réservoirs de rats péridomestiques (produisant la peste de type bubonique), les deux pouvant être influencés par les effets du climat sur la densité et le comportement de la population humaine (Earn et coll., 2020). Une série chronologique de 56 ans de cas de peste chez l’humain dans l’ouest des États-Unis a été utilisée pour étudier les effets des modèles climatiques sur l’incidence de la peste. Comme en Asie centrale, un climat plus chaud et plus humide a été associé à une augmentation du nombre de cas chez l’humain (Ben Ari et coll., 2008). Dans une étude consécutive, le même groupe a trouvé que la combinaison du phénomène El Niño-oscillation australe et de l’oscillation décennale du Pacifique, en favorisant la transition vers un climat plus humide, avait une incidence sur la dynamique de la peste dans l’ouest des États-Unis. Le mécanisme sous-jacent pourrait comprendre des changements dans les précipitations et les températures qui ont une incidence sur les hôtes et les vecteurs comme en Asie. La neige peut jouer un rôle clé, possiblement par des effets sur l’humidité du sol en été, qui a une incidence sur la survie et le développement des puces, et la croissance de la végétation nécessaire aux rongeurs (Ben Ari et coll., 2010). Les résultats d’une étude sur le lien entre les variables climatiques et la fréquence des cas de peste humaine (de 1960 à 1997) dans le nord-est de l’Arizona et le nord-ouest du Nouveau-Mexique portent à croire qu’il est possible d’estimer le risque de peste en surveillant les variables climatiques clés, plus particulièrement les valeurs des températures maximales quotidiennes en été et les quantités de précipitations décalées dans le temps (un et deux ans) en fin d’hiver (février-mars) (Enscore et coll., 2002).

Des études de modélisation ont été menées sur l’impact des changements climatiques sur la distribution de la peste en Amérique du Nord. Basés sur la modélisation des niches écologiques, les modèles de Holt et coll. (2009) prévoient que, d’ici 2050, les conditions climatiques pourraient réduire le risque de peste dans les zones sud de la Californie et accroître le risque le long de la côte nord et dans les Sierras. Une étude réalisée par Nakazawa et coll. (2007) a révélé que la maladie se déplace en fonction des changements climatiques, mais que les changements géographiques globaux seront probablement subtils, avec un certain déplacement des limites sud vers le nord et peut-être un déplacement des limites nord vers le nord également. Des études sur les espèces de puces vectrices Y. pestis dans les populations de chiens de prairie au Canada ont suggéré que le nombre de puces par individu variait inversement au nombre de jours de la saison de croissance précédente ayant reçu plus de 10 mm de précipitations, un indice du nombre d’événements de précipitations qui pourraient avoir causé une augmentation substantielle et prolongée de l’humidité du sol et de la croissance végétative (Eads et Hoogland, 2017). En dehors de ces études, aucune tentative n’a été faite pour évaluer précisément comment les changements climatiques peuvent avoir un impact sur la dynamique de la peste et son aire de répartition géographique au Canada, et aucune donnée de surveillance sur le terrain n’est disponible pour étudier les impacts climatiques sur les aléas environnementaux liés à la peste au Canada. La peste est une maladie à déclaration obligatoire à l’échelle nationale, mais un seul cas chez l’humain, qui a survenu en 1939, a été recensé (gouvernement du Canada, 2018a).

La maladie de Chagas est causée par le parasite protozoaire Trypanosoma cruzi et est une infection qui est le plus souvent contractée par contact avec les matières fécales du triatome (punaise américaine), un insecte hématophage qui se nourrit de sang humain et animal. La maladie de Chagas a une phase aiguë et chronique et, si elle n’est pas traitée, l’infection dure toute la vie. L’infection peut être légère ou asymptomatique. Il peut y avoir de la fièvre et de l’enflure autour du site d’inoculation. Bon nombre de personnes peuvent demeurer asymptomatiques toute leur vie, mais de 20 % à 30 % des personnes infectées développeront tôt ou tard des problèmes médicaux débilitants et parfois mortels (Centers for Disease Control and Prevention, 2018e). La maladie de Chagas n’est pas présente au Canada, et si la plupart des 300 000 cas de maladie de Chagas estimés chez les personnes vivant aux États-Unis ont probablement été acquis dans des pays d’Amérique latine, des cycles de transmission de T. cruzi impliquant des hôtes animaux et des humains, et des infections humaines autochtones transmises par un vecteur ont été signalés dans les États américains du Texas, de la Californie, du Tennessee, de la Louisiane et du Mississippi (Steverding, 2014).

La prévalence de la maladie de Chagas est probablement sous-estimée et son impact se fait sentir sur le système de soins de santé et l’économie mondiale en raison du dépistage et du traitement limités et d’un manque de sensibilisation chez les professionnels de la santé (Click Lambert et coll., 2008; Bern et Montgomery, 2009). L’impact potentiel des changements climatiques sur les vecteurs de la maladie de Chagas en Amérique du Nord a été étudié à l’aide de la modélisation des niches écologiques; bien que l’on ait prédit l’expansion de l’aire de répartition de certaines espèces vers le nord, aucune augmentation des risques n’a été relevée pour le Canada (Carmona-Castro et coll., 2018).

6.3.1.5 Zoonoses transmises par les tiques

Les tiques transmettent une vaste gamme d’agents pathogènes bactériens, viraux et protozoaires à l’échelle mondiale (Sonenshine, 2018). Bien qu’il soit généralement admis que les augmentations de température liées aux changements climatiques contribueront probablement à un accroissement général du nombre, du type, du niveau d’activité et de la répartition géographique des tiques en Amérique du Nord (Eisen et coll., 2016; Sonenshine, 2018), l’ampleur des impacts des changements climatiques sur les risques associés aux maladies transmises par les tiques est incertaine et variera probablement d’une région à l’autre. Au Canada, les données probantes indiquent que l’émergence de la maladie de Lyme associée à la propagation de la tique Ixodes scapularis vers le nord est imputable, du moins en partie, au récent réchauffement climatique (Ebi et coll., 2017; Hoegh-Guldberg et coll., 2019).

Les maladies transmises par les tiques qui ont une incidence sur la santé publique sont des zoonoses et, en Amérique du Nord, les hôtes réservoirs naturels sont des animaux sauvages, en particulier des rongeurs. Il existe deux types de tiques : les tiques dures (Ixodidae) et les tiques molles (Argasidae) (Lindquist et coll., 2016). Dans le nord de l’Amérique du Nord, y compris au Canada, la tique molle la plus importante pour la santé publique est la tique Ornithodorus hermsi, qui transmet la bactérie responsable de la fièvre récurrente, Borrelia hermsii. D’autres tiques molles et espèces Borrelia responsables de la fièvre récurrente sont présentes aux États-Unis; Borrelia turicatae et Borrelia parkeri sont transmises par Ornithodoros turicata et Ornithodoros parkeri, respectivement, mais ne sont pas endémiques au Canada en ce moment (Sage et coll., 2017). Les espèces O. hermsi et B. hermsii vivent naturellement dans des cavernes, et les rongeurs sauvages sont les hôtes naturels dont les tiques se nourrissent et les hôtes réservoirs de B. hermsii. Même si les tiques Ornithodorus hermsi et B. hermsii se trouvent le plus souvent dans les grottes des régions montagneuses de l’ouest des États-Unis et ont une répartition limitée dans le sud de la Colombie-Britannique, ils envahissent les chalets dans ces régions, là où la plupart des cas chez l’humain sont contractés (Dworkin et coll., 2008).

La fièvre récurrente transmise par les tiques est une maladie septicémique fébrile dont l’apparition soudaine est suivie de nombreuses rechutes avec des intervalles afébriles (Artsob, 2000; Murray, 2003). La persistance des bactéries et les rechutes s’expliquent par le fait que la bactérie échappe à la réponse immunitaire (Cutler, 2010). Les symptômes sont très variés : éruptions cutanées, lésions oculaires, jaunisse et vomissements (Ogden et coll., 2014b). Toutefois, elle est rare chez les humains au Canada, en raison de la faible fréquence avec laquelle les gens entrent en contact avec des tiques infectées.

La modélisation de niche écologique a permis de déterminer que l’élévation (les plus élevées étant plus favorables) et des plages précises de température et de précipitations étaient des déterminants clés de la présence des tiques O. hermsi et B. hermsii (Sage et coll., 2017). Cette même étude a projeté l’expansion de l’aire de répartition vers le nord et l’ouest dans les régions montagneuses de la Colombie-Britannique à l’aide de trois modèles climatiques mondiaux (MCM) (ACCESS1-0, HadGEM2-ES et CCSM4) et de deux estimations des trajectoires de concentration de gaz à effet de serre indiquées par les profils représentatifs d’évolution de concentration (RCP) 4.5 et 8.5. La plus grande expansion de l’aire de répartition au Canada était observée avec le scénario d’émissions de gaz à effet de serre plus élevées, RCP 8.5. Tous les modèles basés sur les scénarios RCP 4.5 et 8.5 prévoyaient une contraction de la répartition aux États-Unis.

Les maladies transmises par les tiques dures posent les plus grands défis en matière de santé publique en Amérique du Nord, et parmi ceux-ci, la plus importante est la maladie de Lyme causée par la bactérie Borrelia burgdorferi. La maladie de Lyme est une maladie qui touche plusieurs systèmes corporels et qui commence par une maladie bénigne aspécifique et, dans la plupart des cas, une éruption cutanée typique appelée érythème migrateur. Si elle n’est pas traitée, la maladie progresse à la maladie de Lyme avec des manifestations neurologiques ou cardiaques et, aux stades avancés, à l’arthrite (Wormser et coll., 2006). Cette bactérie est transmise par la tique Ixodes scapularis (la tique à pattes noires) dans le nord-est et le Haut-Midwest des États-Unis, et dans le sud du centre et de l’est du Canada, et par la tique I. pacificus (la tique à pattes noires occidentale) dans les états américains qui bordent le Pacifique et le sud de la Colombie-Britannique (Bouchard et coll., 2015; Eisen et coll., 2016). Dans le sud de la Colombie-Britannique, l’aire de répartition géographique de I. pacificus, et le risque d’infection par B. burgdorferi que pose la tique, serait assez vaste (Mak et coll., 2010). Toutefois, le risque de contracter la maladie de Lyme est beaucoup plus faible là où I. pacificus est le vecteur, par rapport à la plupart des régions où I. scapularis est le vecteur, en raison des caractéristiques de l’écologie de I. pacificus qui font que la prévalence de l’infection chez cette tique est généralement faible et qu’il est moins probable qu’elle pique les humains (Eisen et coll., 2016). Jusqu’à maintenant, aucune étude n’a été menée pour évaluer les impacts possibles des changements climatiques sur les répartitions futures de I. pacificus et de B. burgdorferi en Colombie-Britannique. La modélisation des distributions actuelles de I. pacificus et de B. burgdorferi en Colombie-Britannique a déterminé que les températures moyennes quotidiennes en janvier et en juillet étaient un déterminant important de la niche écologique de ces espèces, et on s’attend à un impact des changements climatiques sur les distributions vers le nord et possiblement en altitude (Mak et coll., 2010).

Concernant la tique I. scapularis, une série d’études sur le terrain et en laboratoire (Ogden, 2014) ont indiqué que le principal impact de la température sur cette espèce touche les taux de développement et l’activité. Les habitats forestiers au Canada fournissent aux tiques des refuges dans lesquels elles sont protégées contre les effets directs des très basses températures hivernales qui autrement les tueraient. Les évaluations fondées sur un modèle du risque d’occurrence de I. scapularis ont utilisé les effets de la température sur les taux de développement, et donc sur la durée du cycle de vie, pour déterminer les seuils de basse température permettant la persistance des populations de tiques autosuffisantes (Ogden et coll., 2005). Ces limites ont maintenant été largement validées par des études de terrain qui, de concert avec l’analyse des données de surveillance passive des tiques, ont établi un schéma spatiotemporel de l’aire de répartition sud-nord qui s’étend des États-Unis au Canada (et maintenant à l’intérieur du Canada), ce qui cadre avec l’hypothèse selon laquelle le récent réchauffement climatique a été un facteur clé (Ogden et coll., 2010; Leighton et coll., 2012; Clow et coll., 2017; Ebi et coll., 2017).

L’augmentation rapide de l’incidence de la maladie de Lyme au Canada, déterminée par la surveillance nationale (Gasmi et coll., 2017), cadre avec l’expansion observée de l’aire de répartition des tiques I. scapularis et avec l’accroissement de la prévalence de l’infection chez les populations de tiques récemment établies (Ogden et coll., 2013; Clow et coll., 2017) (voir la figure 6.5). En raison du degré élevé de concordance entre les études et des données probantes à l’appui des impacts des changements climatiques, il est possible d’affirmer avec une très grande certitude que l’émergence de la maladie de Lyme dans l’est et le centre du Canada est associée au récent réchauffement climatique. L’émergence observée de la maladie de Lyme au Canada correspond aux effets des changements climatiques sur la tique qui en est le vecteur. Cependant, il y a aussi des données probantes selon lesquelles le réchauffement du climat peut influer sur le risque de maladie de Lyme en raison des effets sur d’autres parties du cycle de transmission, en particulier l’abondance et l’aire de répartition géographique des principaux hôtes réservoir, les rongeurs (Simon et coll., 2014).

D’autres agents pathogènes transmis par les tiques Ixodes scapularis, en plus de B. burgdorferi, émergent au Canada en provenance des États-Unis à mesure que les tiques se propagent vers le nord (tableau 6.3), mais aucune des maladies dont ils sont responsables n’est actuellement à déclaration obligatoire à l’échelle nationale. Des renseignements détaillés à l’égard de ceux-ci sont présentés dans l’encadré 6.3.

Une évaluation basée sur un modèle des effets potentiels des changements climatiques sur l’aire de répartition géographique de la tique Dermacentor variabilis, un vecteur de la fièvre pourprée des montagnes Rocheuses (FPMR) et de la tularémie, qui est déjà endémique dans une grande partie du sud du Canada, semblait indiquer qu’il y aura une expansion de l’aire de répartition de cette tique vers le nord au Canada (Minigan et coll., 2018). Des températures extrêmes prolongées (c.-à-d. élevées ou basses), une faible humidité et des précipitations intenses pourraient nuire à la survie des tiques en réduisant leur activité et en accroissant leur taux de mortalité (Ogden et Lindsay, 2016). Cependant, on s’attend à ce que cela ait moins d’effet sur les tiques que sur les moustiques en raison de la capacité des tiques à trouver refuge dans leurs habitats boisés (Ogden et Lindsay, 2016). Des études de modélisation semblaient indiquer que, bien que l’on prédise que la limite nord de l’aire de répartition géographique des tiques I. scapularis et D. variabilis se déplacera vers le nord en raison des changements climatiques, il y aura également une contraction vers le nord de la limite sud de l’aire de répartition des tiques à mesure que le climat devient trop chaud pour elles (Brownstein et coll., 2005a; Minigan et coll., 2018). Si c’est le cas, cela peut avoir une incidence sur l’exposition aux tiques pour les personnes vivant dans les États du sud des États-Unis, mais il est peu probable que cela ait une incidence sur le risque au Canada. Des études sur la tique I. scapularis semblent indiquer que les tiques du sud-est des États-Unis pourraient s’adapter à un climat chaud (Ogden et coll., 2018), de sorte que cet effet pourrait être minime.

Les facteurs non climatiques déterminent également où les populations de tiques et les cycles de transmission des agents pathogènes peuvent s’établir. Il s’agit notamment des caractéristiques du microhabitat, comme les caractéristiques du sol, qui sont essentielles à la survie des tiques et à l’établissement réussi de nouvelles populations de tiques (Lindsay et coll., 1998; Guerra et coll., 2002). Les modifications des caractéristiques de l’habitat, parallèlement aux changements climatiques, comme la fragmentation de l’habitat, la perte de biodiversité, la disponibilité des ressources et l’aménagement du territoire, ont une incidence sur la dynamique des tiques, leurs hôtes animaux et l’exposition des humains aux tiques (Brownstein et coll., 2005b; Simon et coll., 2014). Dans certaines régions du Canada, l’émergence des tiques I. scapularis et B. burgdorferi est irrégulière et inégale, probablement en raison du caractère favorable de différents boisés pour la survie des tiques, et en raison des variations pour ce qui est de l’abondance des hôtes des tiques (Gabriele-Rivet et coll., 2015). Les changements au chapitre des facteurs non climatiques peuvent entraîner l’émergence de maladies transmises par les tiques. Par exemple, la maladie de Lyme est apparue aux États-Unis au XX^e siècle, probablement en raison du reboisement des terres agricoles et de l’augmentation des populations de cerfs, ce qui a rendu possible l’expansion des populations de tiques (Kilpatrick et coll., 2017).

Bien que la maladie de Lyme et d’autres maladies transmises par les tiques I. scapularis et I. pacificus soient les maladies transmises par les tiques les plus préoccupantes pour la santé publique au Canada à l’heure actuelle, d’autres maladies endémiques transmises par les tiques au Canada (tableau 6.3) pourraient être touchées par le réchauffement du climat ou sont susceptibles de l’être à l’avenir. Il n’y a pas encore de données probantes sur l’impact du réchauffement récent sur ces maladies; toutefois, des données de surveillance indiquent des augmentations récentes de l’abondance et de l’étendue des tiques vectrices de ces autres maladies. Il s’agit notamment de l’abondance accrue de la tique I. cookei (un vecteur de la lignée II du virus Powassan), de la Dermacentor variabilis (un vecteur de la FPMR, de la tularémie et de la fièvre à tiques du Colorado) et de la Rhipicephalus sanguineus (un vecteur de la FPMR) dans l’est du Canada (Gasmi et coll., 2018), et de l’expansion de l’aire de répartition de la tique D. variabilis dans les provinces des Prairies (Dergousoff et coll., 2013) (tableau 6.3).

L’expansion vers le nord de l’aire de répartition de la maladie de Lyme au Canada valide le concept selon lequel :

• l’aire de répartition géographique des tiques et des maladies transmises par les tiques en Amérique du Nord peut être limitée par le climat;
• il est possible que le réchauffement climatique permette l’expansion de l’aire de répartition de ces espèces vers le nord;
• les oiseaux migrateurs et, possiblement, d’autres espèces de mammifères hôtes agissent comme une voie d’introduction de tiques et d’agents pathogènes transmis par les tiques chaque année des États-Unis vers certaines régions du Canada qui deviennent adaptées sur le plan climatique à leur caractère endémique (Ogden et coll., 2008; Nelder et coll., 2019).

Par conséquent, d’autres tiques endémiques aux États-Unis et des agents pathogènes transmis par les tiques qui ne sont pas actuellement endémiques au Canada pourraient se propager vers le nord. L’expansion vers le nord de l’aire de répartition de la tique Amblyomma americanum, un vecteur de la tularémie, du virus Heartland et des agents pathogènes bactériens Ehrlichia ewingii et E. chaffeensis, de même que la cause présumée des allergies à la viande rouge (Reynolds et Elston, 2017), a été observée aux États-Unis (Stafford et coll., 2018). De nombreuses évaluations fondées sur des modèles indiquent que le climat des régions du sud du Canada deviendra adapté pour cette tique en raison du réchauffement climatique (Raghavan et coll., 2019; Sagurova et coll., 2019). Cette tique émergente, de même que les maladies infectieuses et autres problèmes de santé publique qu’elle cause, sont susceptibles de se propager au Canada au cours des prochaines décennies, et seront probablement introduites par des oiseaux migrateurs (Gasmi et coll., 2018; Nelder et coll., 2019).

La présente section porte sur les zoonoses qui peuvent être transmises directement des animaux aux humains (figure 6.6). Les zoonoses transmises dans les aliments et l’eau sont examinées au chapitre 7 : Qualité, quantité et sécurité de l’eau, et au chapitre 8 : Salubrité et sécurité des aliments. Le risque d’infection par les zoonoses transmises directement peut dépendre des effets directs des changements climatiques et des conditions météorologiques sur la survie des agents pathogènes, des effets indirects sur les espèces et les populations hôtes et des effets sur les taux de contact entre les agents pathogènes et les humains. Ensemble, ces facteurs déterminent la fréquence des événements de « passage interespèce », c’est-à-dire lorsque les agents pathogènes sont transmis avec succès des animaux aux humains (Altizer et coll., 2013; Brierley et coll., 2016), de même que la possibilité d’émergence adaptative de zoonoses, qui entraînent ensuite des épidémies ou des pandémies touchant les populations humaines (Ogden et coll., 2017). Les changements climatiques peuvent donc engendrer l’émergence de maladies infectieuses zoonotiques à l’échelle mondiale. On pense que les zoonoses transmises directement, principalement par les espèces sauvages, sont celles qui émergent et réapparaissent le plus souvent à l’échelle mondiale (Jones et coll., 2008).

Les impacts des changements climatiques sur les zoonoses devraient être plus importants dans le Nord qu’ailleurs au Canada, y compris les effets sur les zoonoses d’origine vectorielle, alimentaire et hydrique, de même que les zoonoses transmises directement (Parkinson et coll., 2014). Un impact climatique plus important, conjugué, dans de nombreux cas, à une consommation plus élevée d’aliments traditionnels et prélevés dans la nature¹, donne à penser que les risques d’effets sur la santé seront plus importants dans les collectivités nordiques, en particulier les collectivités autochtones du Nord (Brook et coll., 2009). Un autre problème est lié au fait que, à mesure que fond le pergélisol en raison d’un climat plus chaud, des agents pathogènes qui sont demeurés dormants, mais viables dans les carcasses d’animaux ou le sol, peuvent être libérés dans l’environnement et causer des éclosions de maladies (Revich et coll., 2012). Pour la plupart des zoonoses transmises directement dont il est question dans la présente section, des données étayant la sensibilité aux facteurs climatiques et aux conditions météorologiques soulèvent la possibilité d’impacts actuels et futurs des changements climatiques. Dans de très rares cas, on a tenté d’évaluer de tels impacts. En outre, très peu de zoonoses transmises directement présentent des signes de changement au chapitre des tendances en matière de maladies ou de risques, mais cela peut être imputable, en partie, au manque de surveillance systématique de ces maladies au Canada.

6.3.2.1 Zoonoses virales

À l’échelle mondiale, les virus de la grippe aviaire A représentent l’un des groupes de zoonoses virales transmises directement les plus hautement pathogènes, et leurs impacts sont considérables. Des épidémies mondiales de virus de la grippe aviaire hautement pathogènes (pour les humains) sont survenues au cours des dernières décennies (Goneau et coll., 2018), et des éclosions se sont produites dans la volaille domestiquée au Canada, ce qui a fait craindre l’apparition de cas chez l’humain (Skowronski et coll., 2007). Chez les humains, la maladie varie d’une maladie légère à une maladie grave, avec des taux élevés de mortalité (Neumann, 2015). Les principaux réservoirs des virus de la grippe aviaire sont les oiseaux sauvages, en particulier le gibier d’eau (c.-à-d. les cygnes, les oies et les canards). Les virus de la grippe porcine sont également très préoccupants sur le plan de la santé publique, bien que ces virus soient maintenant principalement établis chez le porc domestiqué, et que les impacts des changements climatiques soient relativement peu probables (Schultz-Cherry et coll., 2011) Les virus pandémiques de la grippe, comme les virus H1N1 de 1918 et de 2009, émergent à la suite de la recombinaison (un processus moléculaire) des virus de la grippe aviaire, porcine et humaine (Neumann et coll., 2009). En raison du niveau élevé de menace que représentent les virus zoonotiques et pandémiques de la grippe, il y a une surveillance approfondie de ces virus chez les animaux sauvages et domestiqués et les humains à l’échelle mondiale, de même qu’au Canada (gouvernement du Canada, 2017; gouvernement du Canada, 2018b), et un programme de préparation aux pandémies est en place (gouvernement du Canada, 2019b).

L’émergence et la réémergence des risques de grippe aviaire chez les humains pourraient être imputables à un certain nombre d’effets des changements climatiques sur l’écologie des virus, y compris les habitudes de migration des oiseaux et les changements dans l’aménagement du territoire et les modes de production du bétail (Morin et coll., 2018). La transmission des virus de la grippe aviaire chez les oiseaux sauvages, qui est souvent une transmission fécale-orale par l’eau, peut être inhibée par le réchauffement climatique, car la survie des virus est meilleure dans l’eau froide que dans l’eau chaude (Morin et coll., 2018). Dans le même ordre d’idées, la prévalence des oiseaux infectés était plus élevée, selon une étude canadienne, si l’échantillonnage était précédé d’une période de temps froid (Papp et coll., 2017), et les données phylogénétiques semblent indiquer que les virus de la grippe A ont en fait émergé après le petit âge glaciaire (Gatherer, 2010). Toutefois, la complexité associée à la transmission mondiale des virus de l’influenza aviaire signifie que, même si les virus de l’influenza aviaire sont intrinsèquement sensibles au climat, les changements climatiques pourraient avoir des répercussions positives en réduisant la transmission de la maladie en raison des effets sur la survie des virus dans l’environnement, ou négatives en accroissant la transmission par les effets indirects d’autres facteurs (Gilbert et coll., 2008; Gatherer, 2010; Morin et coll., 2018).

La rage est une maladie d’origine zoonotique qui représente un problème de santé mondial majeur, avec plus de 55 000 décès chaque année (Knobel et coll., 2005). Le virus de la rage est capable d’infecter les tissus du cerveau et du système nerveux de tous les mammifères, ce qui entraîne habituellement des modifications des comportements suivies de la mort (OMS, 2013). Au Canada, la rage est associée à plusieurs espèces sauvages, dont les chauves-souris, les mouffettes, les ratons laveurs et les renards, qui maintiennent des variants viraux distincts circulant de façon endémique au sein de leurs populations (Rosatte, 1988; Tinline et Gregory, 2020). Les cas humains de rage sont rares au Canada, avec seulement trois cas contractés au pays depuis 2000 (Filejski, 2016), mais l’exposition humaine aux animaux enragés suivie de l’administration d’un traitement prophylactique post-exposition se produit chaque année dans tout le pays.

Bien que les changements écologiques causés par les facteurs climatiques soient susceptibles d’avoir une incidence sur la circulation de la rage dans chacune de ses populations hôtes respectives dans une certaine mesure, ces impacts seront probablement ressentis d’abord et avant tout dans l’Arctique. La rage sévit dans tout l’Arctique et est considérée comme enzootique – ou prévalente – dans le nord du Canada, c’est-à-dire au nord du 60e parallèle (voir le chapitre 2 : Changements climatiques et santé des Autochtones du Canada). Le principal hôte réservoir de la rage dans l’Arctique est le renard arctique (Vulpes lagopus).

La rage dans l’Arctique est causée par une souche unique du virus de la rage appelée « variant arctique du virus de la rage », qui circule dans les régions arctiques et subarctiques avec des incursions sporadiques vers les régions plus au sud, ce qui mène parfois à l’établissement de la rage enzootique dans ces régions (Rosatte, 1988). Dans l’Arctique canadien, les cas de rage chez les animaux domestiques et les animaux sauvages sont signalés chaque année, et les résidents de l’Arctique reçoivent plus de traitements prophylactiques contre la rage par habitant que toute autre population au Canada (Rosatte, 1988; Mitchell et Kandola, 2005; Aenishaenslin et coll., 2014; ACIA, 2019).

Les changements climatiques sont plus rapides et plus vastes dans le nord du Canada que les moyennes mondiales et canadiennes (Larsen et coll., 2014; Bush et Lemmen, 2019). Bien que les impacts à long terme du réchauffement rapide du climat sur la rage dans l’Arctique n’aient pas encore été documentés, l’écologie et l’épidémiologie de la rage risquent d’être modifiées par les perturbations continues des écosystèmes arctiques causées par le climat. Il s’agit notamment des cycles de décroissance des populations de lemmings, une source essentielle de nourriture pour les renards arctiques (Fuglei et Ims, 2008; Kausrud et coll., 2008), de la réduction de la durée et de l’étendue de la glace de mer utilisée par les renards pour l’alimentation et les déplacements hivernaux (Kim et coll., 2016), et de l’expansion de l’aire de répartition des renards roux (Vulpes vulpes) vers le nord. Les renards roux font compétition aux renards arctiques pour les ressources et sont un hôte réservoir compétent pour le variant de la rage dans l’Arctique (Rosatte, 1988; Hersteinsson et MacDonald, 1992; Gallant et coll., 2012). Selon une étude de modélisation récente (Simon et coll., 2019), l’incidence de la rage pourrait d’abord se stabiliser en raison de la réduction de la variation de la dynamique des proies, les interactions entre les renards arctiques et roux intensifiant les éclosions là où ces espèces se chevauchent. Toutefois, à long terme, le déplacement des renards arctiques par les renards roux et la baisse d’activité hivernale en raison de la réduction de l’étendue de la glace de mer peuvent limiter la transmission de la rage dans les régions plus chaudes. De même, Huettmann et coll. (2017) ont prédit une réduction de la niche écologique actuelle du virus de la rage en Alaska avec le réchauffement climatique.

Les hantavirus causent des infections dans les populations de rongeurs sauvages et de mammifères insectivores et peuvent entraîner le syndrome pulmonaire à hantavirus, une fièvre suivie d’un œdème pulmonaire aigu et de l’entrée en état de choc. Il n’y a pas de traitement particulier pour le syndrome pulmonaire à hantavirus; le taux de mortalité est de 38 % au Canada (Drebot et coll., 2000), où on signale en moyenne quatre cas chaque année (gouvernement du Canada, 2015). Les humains contractent l’infection par le contact avec des rongeurs infectés ou leurs excréments, en particulier l’urine ou les fèces aérosolisées (Weir, 2005). Dans un rapport précédent (Charron et coll., 2008), il a été déterminé que l’incidence des hantavirus est sensible aux facteurs climatiques et est associée aux effets sur les populations de rongeurs. Il n’y a pas eu d’autres études sur les hantavirus au Canada, et les impacts potentiels des changements climatiques sont inexplorés.

6.3.2.2 Zoonoses parasitaires

Au Canada, les protozoaires zoonotiques Cryptosporidium, Giardia et Toxoplasma sont les parasites les plus importants pour la santé publique, selon l’opinion d’experts, et les deux premiers sont à déclaration obligatoire à l’échelle nationale (ONUAA et OMS, 2014). Les protozoaires Cryptosporidium et Giardia spp. peuvent être transmis directement par les animaux, par exemple, les animaux de ferme nouveau-nés ou les animaux des zoos pour enfants. Il peut également y avoir transmission d’une personne à une autre par l’intermédiaire de contacts étroits et d’éclosions dans des milieux communautaires ou de soins, ou par les voies alimentaire ou hydrique. Les changements climatiques auront une incidence sur les infections par ces parasites en modulant la transmission d’origine alimentaire et hydrique (voir le chapitre 7 : Qualité, quantité et sécurité de l’eau et le chapitre 8 : Salubrité et sécurité des aliments).

À l’heure actuelle, le fardeau humain de la maladie, y compris les lésions neuronales et oculaires associées à la migration larvaire viscérale (c.-à-d. la migration des larves dans le corps) des ascarides zoonotiques (c.-à-d. les vers ronds) Baylisascaris procyonis et Toxocara canis, n’est pas connu au Canada, et seuls les cas isolés et les données d’enquêtes de sérosurveillance sont signalés (Embil et coll., 1988; Sapp et coll., 2016). Les hôtes réservoirs de ces ascarides sont, respectivement, les ratons laveurs et les chiens domestiques. Dans le sud du Canada, les chiens sont aussi des hôtes compétents pour les ascarides B. procyonis (Lee et coll., 2010). Une étude nationale au Canada a rapporté que le parasite Toxocara canis était celui qui était le plus souvent détecté dans les fèces des chiens dans les refuges (Villeneuve et coll., 2015). La transmission directe des chiens aux humains est possible par contact avec des œufs embryonnés présents sur la fourrure de l’animal, mais en général, on pense que le parasite T. canis est principalement acquis à partir d’œufs embryonnés présents dans l’environnement (Keegan et Holland, 2010).

Les œufs de ces deux ascarides passent par un stade de développement dans l’environnement qui est dépendant de la température avant de devenir infectieux pour les humains. Par conséquent, les principaux mécanismes par lesquels les changements climatiques peuvent avoir une incidence sur ces parasites sont l’amplification locale due à un développement plus rapide et à une survie accrue des œufs déposés dans les fèces des hôtes définitifs (c’est-à-dire ceux dans lesquels la reproduction du parasite a lieu), et l’expansion vers le nord de l’aire de répartition en raison des changements dans la distribution et l’abondance des hôtes canins et des ratons laveurs. Les œufs de T. canis sont sensibles au gel (O’Lorcain, 1995) et leur développement est retardé après refroidissement, mais les œufs de B. procyonis peuvent survivre aux températures de congélation et aux cycles de gel-dégel (Shafir et coll., 2011). Cela porte à croire qu’un climat en évolution peut avoir différents effets sur ces parasites. Pour le parasite B. procyonis, l’expansion vers le nord pourrait suivre celle de l’hôte principal, le raton laveur, dont l’aire de répartition est actuellement limitée aux parties du sud des provinces canadiennes (Naughton, 2012). Dans le cas du T. canis, l’expansion de l’aire de répartition vers le nord et l’amplification locale peuvent suivre l’augmentation du taux de survie et de développement des œufs dans l’environnement. L’augmentation de la circulation des deux parasites chez les chiens peut entraîner une augmentation des maladies chez les Canadiens et les Canadiennes en raison de leur lien étroit. Jusqu’à maintenant, aucune étude n’a examiné explicitement les effets des changements climatiques sur ces parasites. Toutefois, des œufs de T. canis ont récemment été signalés au Canada chez des chiens au nord du 60^e parallèle pour la première fois (Salb et coll., 2008), ce qui pourrait indiquer une expansion de l’aire de répartition de cette espèce vers le nord (Jenkins et coll., 2011).

Jusqu’à récemment, on pensait que le cestode zoonotique Echinococcus multilocularis n’était transmis entre les canidés sauvages et les rongeurs que dans les régions du sud des provinces des Prairies et de la toundra arctique, et un seul cas humain autochtone avait été documenté au Canada (James et Boyd, 1937; Deplazes et coll., 2017). Les œufs d’Echinococcus sont excrétés dans les fèces des canidés sauvages ou domestiques, sont immédiatement infectieux et peuvent adhérer à la fourrure de l’hôte. L’infection peut se produire chez l’humain lorsqu’il consomme ces œufs par inadvertance. La transmission peut également se produire par la consommation de produits non lavés ou la consommation d’eau de surface non filtrée dans des environnements fortement contaminés (Deplazes et coll., 2017). Chez les humains, le parasite s’établit d’abord dans le foie et se comporte comme une tumeur parasitaire, finissant par produire des métastases dans tout l’abdomen, à moins d’une intervention chirurgicale et médicale agressive. Plus de cas d’échinococcose alvéolaire ont récemment été détectés chez les chiens et les humains au Canada, et le parasite a élargi son aire de répartition pour inclure la majeure partie de l’Ouest canadien (Deplazes et coll., 2017) et la partie sud de l’Ontario (Kotwa et coll., 2019). Cette émergence est probablement liée à la fois à l’introduction de souches européennes du parasite, qui se sont maintenant établies avec succès chez les espèces sauvages, et à l’accroissement des taux de contact entre les humains et la faune urbaine.

Les mécanismes possibles des répercussions des changements climatiques sur ce parasite comprennent des effets sur la survie des œufs, car ceux-ci sont résistants à l’environnement, mais sensibles aux températures élevées et à la dessiccation, de même que la stabilisation et l’amplification des populations d’hôtes intermédiaires (rongeurs), ce qui était considéré comme un facteur limitant le contrôle de ce parasite (Rausch, 1956; Jenkins et coll., 2013). Une corrélation a été établie entre les variables climatiques, à la fois la température et les précipitations, et la prévalence de l’infection chez les hôtes définitifs et intermédiaires (c.-à-d. les hôtes où il n’y a pas de reproduction parasitaire) (Takeuchi-Storm et coll., 2015), qui peut être associée à des effets directs sur la survie des œufs dans l’environnement ou des impacts sur les hôtes réservoirs (Mas-Coma et coll., 2008). Le parasite fait maintenant l’objet d’une déclaration obligatoire provinciale en Alberta et en Ontario. Les chiens peuvent servir d’hôtes définitifs et intermédiaires pour E. multilocularis et, par conséquent, un traitement régulier à l’aide d’un médicament anthelminthique administré aux chiens dont la consommation d’hôtes intermédiaires de rongeurs est connue peut aider à atténuer le risque pour l’humain (Jenkins, 2017).

6.3.2.3 Zoonoses bactériennes

Les bactéries de l’espèce Brucella, qui sont endémiques au Canada et qui causent des maladies chez les humains, sont Brucella abortus et B. suis biotype 4. On retrouve la bactérie Brucella abortus dans le bétail, lorsque la prévention de la maladie n’est pas assurée au moyen de programmes de lutte, et les ongulés sauvages comme le cerf et le bison (Nishi et coll., 2002). La bactérie Brucella suis biotype 4 s’attaque au caribou (Forbes, 1991). Chez les humains, la brucellose cause une fièvre persistante et souvent récurrente accompagnée de fatigue chronique et d’autres symptômes comme l’arthrite (Centers for Disease Control and Prevention, 2019b). Chez les animaux, le principal effet de l’infection est l’avortement. La principale voie de transmission vers la population humaine est d’origine alimentaire, mais les personnes qui travaillent dans les industries du bétail et de la transformation des aliments peuvent la contracter par contact direct avec des tissus du bétail infecté (Hunter et coll., 2015), tout comme les chasseurs peuvent la contracter par contact direct avec des tissus d’animaux sauvages infectés (Franco-Paredes et coll., 2017). Mis à part leurs effets directs possibles sur la survie de la bactérie Brucella spp. dans l’environnement, et donc sur la transmission d’animaux à animaux, les changements climatiques peuvent avoir une incidence sur la transmission par des effets sur la dynamique des populations d’hôtes sauvages (Cross et coll., 2007). Bien que la brucellose puisse être une maladie sensible au climat, aucune étude n’a été réalisée pour explorer les effets possibles des changements climatiques.

Causé par la bactérie Bacillus anthracis, le risque d’anthrax dans l’environnement est amplifié par les ongulés sauvages et domestiqués infectés qui souffrent de maladies hémorragiques à la suite d’une infection. Lorsque l’animal infecté meurt, son sang et sa carcasse contaminent les sols avec des bactéries qui forment des spores résistantes et persistantes (Valseth et coll., 2017). Les humains peuvent contracter l’infection par l’inhalation des spores, par l’ingestion des spores qui contaminent la nourriture ou l’eau, ou par l’introduction des spores dans la peau par le biais d’une coupure.

Les manifestations chez les humains dépendent de la voie de l’infection – manifestations cutanées après l’infection des coupures, manifestations gastro-intestinales après l’ingestion et manifestations respiratoires après l’inhalation. Le taux de décès est élevé (environ 25 %) chez les personnes non traitées (Centers for Disease Control and Prevention, 2017). Des températures élevées ont été associées à des éclosions chez des animaux sauvages et domestiqués dans des pays du Nord, dont le Canada, et on s’attend à ce que l’environnement devienne plus favorable à la transmission de l’anthrax et à la survie de la bactérie B. anthracis dans le nord et le centre-sud du Canada en raison du réchauffement climatique (Walsh et coll., 2018). La nature persistante des spores de B. anthracis dans les sols permet l’apparition d’épidémies causées par les conditions météorologiques qui peuvent devenir plus fréquentes avec les changements climatiques en raison des effets combinés du réchauffement et des inondations (Maksimovic et coll., 2017). L’anthrax et la brucellose sont des maladies à déclaration obligatoire lorsqu’elles sont dépistées dans le bétail au Canada (gouvernement du Canada, 2019c).

La fièvre Q est causée par la bactérie Coxiella burnetii. Cette bactérie est principalement transmise aux humains par voie aérienne dans les élevages de ruminants infectés, en particulier les élevages de moutons et de chèvres. Chez les humains, l’infection cause de la fièvre ainsi qu’une pneumonie, des infections du foie et des infections chroniques du cœur, et le taux de mortalité sans traitement est élevé (jusqu’à 25 %) (Centers for Disease Control and Prevention, 2019c). Chez les ruminants, il y a peu de manifestations cliniques au-delà de l’avortement si l’animal est infecté à la fin de la grossesse. Les animaux infectés excrètent les bactéries dans le lait, l’urine, les fèces, le placenta et les liquides de naissance (Plummer et coll., 2018). La bactérie persiste dans l’environnement; bien que les travailleurs agricoles soient les plus à risque, de grandes éclosions associées à la transmission aérienne sur de longues distances à partir des fermes touchées ont eu lieu en Europe (Schneeberger et coll., 2014). La fièvre Q n’est pas à déclaration obligatoire à l’échelle nationale au Canada, mais on pense qu’elle est particulièrement répandue dans les fermes du Québec (Dolcé et coll., 2003), bien que la raison en soit inconnue. Une incidence accrue a été associée à une augmentation des précipitations dans les Caraïbes, ce qui semble indiquer une sensibilité aux conditions météorologiques (Eldin et coll., 2015; Sivabalan et coll., 2017). La dispersion de la bactérie augmente avec la vitesse du vent et un faible taux d’humidité, mais la réduction des précipitations associées aux changements climatiques dans certaines régions peut réduire la concentration de cet agent pathogène en suspension dans l’air (van Leuken et coll., 2016). Il n’existe aucune étude sur les effets possibles des changements climatiques.

La présente section est axée sur le sous-ensemble d’infections qui sont transmises directement d’une personne à une autre. La transmission directe peut être définie comme la transmission d’un agent infectieux entre des personnes par contact direct ou par des gouttelettes respiratoires plutôt que par des aliments, l’eau ou des arthropodes vecteurs. Le contact direct se produit par contact peau à peau, tandis que la propagation par les gouttelettes fait référence aux aérosols relativement gros et de courte portée produits par les éternuements et la toux ou en parlant (Dicker et coll., 2012). Les infections transmises directement causent un large éventail de maladies, et de nombreuses caractéristiques de la population humaine – comme l’évolution de la démographie et des comportements humains, les modèles de connectivité et le respect des recommandations en matière de santé publique (p. ex., vaccination contre la grippe) – ont un effet sur le fardeau de ces maladies au sein de la population (Heesterbeek et coll., 2015).

Le taux de reproduction de base (R₀) (c.-à-d. le nombre de cas secondaires causés par un cas de maladie primaire au sein d’une population totalement vulnérable et en l’absence d’intervention) est une mesure importante de la transmissibilité (Pandemic Influenza Outbreak Research Modelling Team, 2009). Dans le cas des agents pathogènes transmis directement, le R₀ est fonction de la durée de l’infection, du taux de contact effectif d’une personne infectée et de la « contagiosité » d’un cas individuel (Pandemic Influenza Outbreak Research Modelling Team, 2009). Si l’un ou l’autre de ces facteurs est modifié directement ou indirectement par les changements climatiques, il en résultera un changement dans l’épidémiologie des maladies. L’augmentation du R₀ peut alourdir le fardeau des maladies endémiques et accroître les risques d’éclosion et d’émergence de maladies. En fait, les impacts des changements climatiques sur l’habitat humain, la productivité agricole, les conflits, les moyens de subsistance et la stabilité politique entraîneront probablement des déplacements de populations et des modifications des schémas de mélange de populations qui auront des répercussions sur les maladies transmissibles; le lien entre les conflits humains, les déplacements de populations, les migrations à grande échelle et les maladies transmissibles a été démontré à maintes reprises dans un passé proche et lointain (Rabaan, 2019). Ces impacts de deuxième et de troisième ordre des changements climatiques sur les maladies transmissibles peuvent éclipser les changements de premier ordre dans l’épidémiologie en raison des impacts sur les hôtes et les agents pathogènes.

De nombreuses études ont cerné les impacts des conditions météorologiques et climatiques sur les maladies infectieuses transmises directement d’une personne à une autre, mais les études qui tentent d’analyser explicitement les effets des changements climatiques font défaut. Seuls les effets pour la maladie mains-pieds-bouche (MMPB) ont été étudiés jusqu’à maintenant, et aucun effort n’a été déployé pour attribuer les changements survenus dans l’incidence de la maladie aux changements climatiques récents.

Un indicateur possible de la modification liée aux facteurs climatiques de l’épidémiologie des maladies transmissibles directement est leur saisonnalité. La saisonnalité de ces infections est bien connue et a fait son chemin dans le langage courant (p. ex., « saison de la grippe »). Si les mécanismes qui sous-tendent le caractère saisonnier des maladies transmissibles restent mal compris (Fisman, 2007; Greer et coll., 2008; Fisman, 2012), un nombre croissant d’ouvrages ont cherché à distinguer la contribution des facteurs environnementaux à la transmission des maladies de celle d’autres facteurs saisonniers, tels que les comportements humains saisonniers (fréquentation scolaire, vacances et rassemblement à l’intérieur) et les facteurs neuro-endocriniens (p. ex., mélatonine, vitamine D) (Dowell, 2001). De nombreux agents pathogènes viraux et bactériens, en particulier ceux qui causent une infection respiratoire et gastro-intestinale, présentent une saisonnalité marquée dans des climats tempérés comme celui du Canada, ce qui indique que les facteurs environnementaux sont d’importants déterminants du risque de maladie, et que les changements environnementaux peuvent entraîner des changements importants dans l’épidémiologie des maladies.

6.3.3.1 Infections respiratoires

Les infections respiratoires sont le facteur qui contribue le plus au fardeau global de la maladie dans le monde (Ferkol et Schraufnagel, 2014); elles représentaient la troisième cause de décès dans le monde en 2015 (Global Burden of Disease, 2015; Mortality and Causes of Death Collaborators, 2016). À cela s’ajoute maintenant la COVID-19; toutefois, à ce jour, il n’y a aucune preuve de l’incidence des conditions météorologiques et climatiques sur l’émergence et la propagation de cette maladie. Les maladies respiratoires transmissibles comprennent les maladies causées par des agents pathogènes viraux et bactériens. Pour de nombreuses maladies respiratoires d’origine virale, comme la grippe, un large éventail de manifestations sont courantes; la plupart des gens souffrent d’une maladie légère à modérée qui guérit sans traitement. Toutefois, une proportion de la population sera plus gravement malade ou développera une infection bactérienne secondaire qui nécessitera une hospitalisation. On estime qu’au Canada, une moyenne de 12 200 hospitalisations (Schanzer et coll., 2006; Schanzer et coll., 2008; Schanzer et coll., 2013a; Schanzer et coll., 2013b) et environ 3 500 décès sont imputables à la grippe chaque année (Schanzer et coll., 2013b). Les infections respiratoires graves sont plus fréquentes aux extrêmes d’âge (jeune et vieux) (Ampofo et coll., 2006; Schanzer et coll., 2006; Schanzer et coll., 2008; Schanzer et coll., 2013a; Schanzer et coll., 2013b).

Dans les régions tempérées, des infections respiratoires virales, comme la grippe et le virus respiratoire syncytial (VRS), peuvent se produire tout au long de l’année, mais on observe un pic épidémique saisonnier pendant les mois d’hiver (Thompson et coll., 2006; Rohr et coll., 2011). Le caractère saisonnier prévisible des infections respiratoires virales hivernales a amené les chercheurs à évaluer si les conditions environnementales pouvaient influer sur le moment de l’apparition ou la gravité des épidémies saisonnières de grippe. Certaines données indiquent que la baisse de l’humidité absolue (Shaman et coll., 2010), la baisse de la température (Earn et coll., 2012; Skog et coll., 2014), ou les deux (Chattopadhyay et coll., 2018) peuvent déclencher le début de la saison de la grippe dans les pays tempérés. La baisse des températures et la diminution de l’humidité absolue peuvent également accroître la transmissibilité de la grippe et des maladies semblables pendant les épidémies (Tang et coll., 2010; Roussel et coll., 2016; Caini et coll., 2018).

La gravité des saisons de la grippe est réduite en présence de fortes conditions du phénomène El Niño-oscillation australe (Viboud et coll., 2004; Choi et coll., 2006), ce qui fournit d’autres données probantes qui étayent la sensibilité au climat. Cette inversion thermique dans l’océan Pacifique est associée à des conditions inhabituellement chaudes et pluvieuses semblables à celles prévues dans les scénarios de changements climatiques (Fisman et coll., 2016). Compte tenu de l’augmentation apparente de la transmission de la grippe par temps froid, on pourrait s’attendre à ce que les changements climatiques aient pour effet de réduire le fardeau de la maladie associée aux infections respiratoires virales. Cependant, les effets du climat sur l’épidémiologie de la grippe peuvent dépendre de l’échelle temporelle. Une analyse du climat et des épidémies de grippe saisonnière antérieures aux États-Unis de 1997 à 2013 a révélé que des hivers doux étaient associés à des épidémies précoces et graves au cours de l’année suivante (Towers et coll., 2013). La diminution de la transmission de la grippe au cours d’une saison donnée peut donner lieu à une hausse du nombre de personnes vulnérables et, par conséquent, à une épidémie de grippe plus explosive au cours de la saison suivante. En outre, il a été suggéré que l’augmentation des températures mondiales pourrait causer un accroissement du taux de diversification de la grippe, ce qui pourrait diminuer l’immunité protectrice et donner lieu à des pandémies de grippe plus fréquentes (Gatherer, 2010).

Plusieurs agents pathogènes respiratoires humains bactériens importants présentent un caractère saisonnier stéréotypé. Les infections à Streptococcus pneumoniae et à Neisseria meningitidis, qui peuvent être causées en partie par un risque accru en raison d’une grippe antérieure et d’une infection par le VRS, sont plus courantes en hiver (Tuite et coll., 2010; Kuster et coll., 2011). Des impacts environnementaux directs sur ces infections sont également possibles. Les infections pneumococciques invasives ont tendance à être fortement saisonnières dans les climats tempérés, ce qui entraîne des corrélations causales avec le froid (Cilloniz et coll., 2017). Cependant, il a été suggéré que la diminution du rayonnement UV hivernal, qui est moins susceptible d’être touché par les changements climatiques que les régimes de température ou de précipitations, pourrait expliquer cette saisonnalité hivernale (White et coll., 2009). Des travaux de modélisation plus récents indiquent que la saisonnalité des infections pneumococciques peut être complexe et déterminée par les recoupements entre les profils de contact de la population, les conditions météorologiques hivernales et les infections respiratoires virales prédisposantes (Domenech de Cellès et coll., 2019). Les infections à méningocoques ont toujours été très saisonnières en Afrique subsaharienne, l’apparition de l’épidémie étant liée à la période des vents de Harmattan (Sultan et coll., 2005). Dans les régions tempérées, l’incidence des infections invasives à méningocoques atteint souvent un sommet à la fin de l’hiver ou au début du printemps (Rosenstein et coll., 2001; Lindsay et coll., 2002; Brachman et Abrutyn, 2009). Cependant, les liens avec les facteurs environnementaux, bien qu’ils soient déterminés dans des régions individuelles, ne sont pas les mêmes d’une région à l’autre (Collier, 1992; Lindsay et coll., 2002; Sultan et coll., 2005; Michele et coll., 2006; Kinlin et coll., 2009). On prévoit que la fréquence accrue des événements météorologiques extrêmes, y compris les chutes de pluie abondantes, accompagnera les changements climatiques, et l’augmentation des maladies respiratoires a été associée à l’exposition aux eaux de crue (De Man et coll., 2016). Toutefois, il est probable que ces maladies soient imputables à des agents pathogènes d’origine environnementale (p. ex., Legionella, tel qu’il est décrit ci-dessous) et à des agents pathogènes d’origine hydrique, qui sont abordés ailleurs dans le présent rapport (voir le chapitre 7 : Qualité, quantité et sécurité de l’eau).

6.3.3.2 Infections gastro-intestinales

Comme pour les infections virales respiratoires, les infections virales du tractus gastro-intestinal sont très saisonnières. Les infections entériques, y compris l’échovirus, les virus coxsackie A et B, et, avant qu’il ne soit maîtrisé, le poliovirus, sont associés à des éclosions à la fin de l’été et au début de l’automne dans les pays tempérés (Moore, 1982). Les norovirus et les rotavirus sont courants en hiver (Greer et coll., 2009; Patel et coll., 2013). Les entérovirus sont habituellement transmis par voie fécale-orale et peuvent causer des maladies reconnaissables, notamment la MMPB, les infections neuroinvasives (p. ex., paralysie flasque aiguë) et des syndromes aspécifiques, y compris la méningite virale, l’encéphalite, la myocardite, la gastroentérite et la conjonctivite. Les norovirus et les rotavirus sont associés à la gastroentérite et les norovirus, en particulier, peuvent causer d’importantes éclosions de sources ponctuelles, y compris celles qui surviennent dans des milieux fermés comme les navires de croisière et les établissements de soins de longue durée (Rajagopalan et Yoshikawa, 2016; Mouchtouri et coll., 2017).

Les mécanismes qui sous-tendent la saisonnalité des infections aux entérovirus ne sont pas entièrement compris. Cependant, Dowell (2001) a souligné que le caractère saisonnier de la poliomyélite devient plus évident avec la distance par rapport à l’équateur, et qu’il ne paraît pas dans les régions périéquatoriales, ce qui laisse entendre que les changements saisonniers des conditions météorologiques sont des facteurs clés de la saisonnalité des entérovirus. Il a été suggéré que la température module la reproduction et la survie des particules virales, et que l’humidité modifie la fixation des particules virales aux gouttelettes d’eau, facilitant ainsi la transmission (Patz et coll., 2005; Wong et coll., 2010). Conformément à ces hypothèses, des températures élevées ont été associées à un risque accru de MMPB dans plusieurs pays d’Asie (e.g., Hii et coll., 2011; Onozuka et Hashizume, 2011), une à deux semaines plus tard. Alors que certaines études semblent montrer que le lien entre la température et le risque de maladie est linéaire (Hii et coll., 2011; Wang et coll., 2016), ou associé à des températures quotidiennes maximales élevées (Sumi et coll., 2017), d’autres semblent révéler des liens non linéaires plus complexes entre le risque et la température (Kim et coll., 2016; Liao et coll., 2016; Zhao et coll., 2018).

L’augmentation de l’humidité relative et des précipitations a également été associée à un risque élevé de MMPB dans la plupart des études (Hii et coll., 2011; Onozuka et Hashizume, 2011; Zhao et coll., 2017), l’humidité pouvant moduler les effets de la température (Kim et coll., 2016; Sumi et coll., 2017). Il a été avancé que les événements de précipitations extrêmes pourraient accroître le risque de MMPB (Cheng et coll., 2014; Yu et coll., 2019). Tel qu’il est susmentionné, la combinaison d’une température plus élevée et de fortes pluies est liée au phénomène El Niño-oscillation australe, et ce phénomène entraîne des augmentations à court terme des cas de MMPB en Chine. Ces observations ont permis de paramétrer des modèles mathématiques qui semblent indiquer une augmentation de 5 % de l’incidence de la MMPB en Chine d’ici 2090, ce qui représenterait un accroissement substantiel du fardeau de la maladie (Zhao et coll., 2018). Si de telles estimations s’appliquent aux infections entérovirales de façon générale, cela pourrait également présenter une augmentation des manifestations actuellement rares, mais graves, de maladies causées par des entérovirus, telles que les infections neuroinvasives et la myocardite.

La hausse des températures et les conditions humides associées aux changements climatiques pourraient donc engendrer une incidence plus forte des maladies entériques endémiques à l’échelle mondiale ainsi qu’une augmentation de la fréquence des épidémies, et favoriser l’émergence de souches d’entérovirus dans de nouvelles régions géographiques en faisant passer le R₀ au-delà du seuil de transmission soutenue de personne à personne. En effet, avec l’émergence récente de la paralysie flasque aiguë due aux entérovirus non poliomyélitiques en Amérique du Nord, y compris au Canada, il est possible que nous assistions actuellement à un phénomène semblable en tout point (Hassel et coll., 2015; Holm-Hansen et coll., 2016; Suresh et coll., 2018). Les vaccins candidats contre l’entérovirus EV-71, un agent important de la MMPB fortement associé aux maladies neuroinvasives, sont en cours de développement; ils ne sont toutefois pas encore disponibles pour utilisation en Amérique du Nord (Zhu et coll., 2014).

Contrairement aux entérovirus, les norovirus et les rotavirus causent la gastroentérite hivernale en Amérique du Nord (Greer et coll., 2009; Patel et coll., 2013). En Espagne, le temps exceptionnellement froid a été associé à un risque accru d’hospitalisations attribuables au rotavirus (Morral-Puigmal et coll., 2018). Bien que le rotavirus soit hautement transmissible de personne à personne, les réservoirs environnementaux (en particulier l’eau) peuvent être importants pour la propagation, et la baisse de la température de l’eau retarde la désintégration du virus dans l’environnement (voir le chapitre 7 : Qualité, quantité et sécurité de l’eau). Des conditions froides et sèches ont également été associées à l’activité des norovirus en Angleterre et au pays de Galles (Lopman et coll., 2009). Par conséquent, le réchauffement climatique au Canada pourrait réduire l’incidence de certains de ces agents pathogènes viraux.

Les maladies infectieuses les plus connues chez les humains, qui ont des sources environnementales autres que les humains infectés, les réservoirs d’animaux ou les arthropodes vecteurs, sont la légionellose et la cryptococcose. Ces types d’infections sont causés par des bactéries et des champignons qui persistent dans les sols et l’eau et qui infectent les humains par inhalation après avoir été aérosolisés ou aéroportés dans la poussière. Pour toutes ces infections, bien qu’il y ait eu des études visant à déterminer les effets des conditions météorologiques et climatiques sur leur occurrence, peu d’études ont été menées pour évaluer les impacts potentiels des changements climatiques. Le texte principal fournit des détails sur les agents pathogènes, les maladies qu’ils causent et leur sensibilité aux conditions météorologiques et climatiques, tandis que les effets potentiels des changements climatiques sont décrits dans l’encadré 6.5, l’encadré 6.6, l’encadré 6.7, l’encadré 6.8 et l’encadré 6.9.

6.3.4.1 Légionellose

L’infection par les bactéries Legionella cause la légionellose, qui se présente comme la maladie du légionnaire, la fièvre de Pontiac ou une infection asymptomatique. La maladie du légionnaire se manifeste par une pneumonie (Stout et Yu, 1997), est souvent grave et peut se transformer en insuffisance respiratoire et défaillance de multiples organes avec un taux de mortalité de 11 % à 25 % (Marston et coll., 1994; Stout et Yu, 1997). La fièvre de Pontiac est plus légère et se caractérise par la fièvre, la fatigue, la myalgie et les maux de tête, avec ou sans toux (Tossa et coll., 2006), et les patients se rétablissent après deux à cinq jours sans traitement. Les personnes à risque accru de légionellose comprennent les personnes âgées, les hommes, les fumeurs et celles qui ont des problèmes sous-jacents comme l’immunosuppression, une maladie pulmonaire chronique, le diabète et le cancer (Marston et coll., 1994; Stout et Yu, 1997).

Les bactéries Legionella sont présentes naturellement dans l’eau douce et le sol et se multiplient dans les protozoaires présents dans l’environnement. Elles deviennent un risque pour la santé humaine lorsqu’elles se multiplient dans l’eau entre 25 °C et 42 °C et qu’elles sont aérosolisées et inhalées dans les poumons (Fields et coll., 2002; OMS, 2007). L’infection par Legionella pneumophila (qui cause plus de 70 % des infections humaines) est contractée par inhalation d’aérosols provenant de systèmes d’eau douce dans les maisons ou dans la collectivité (p. ex., tours de refroidissement, spas, pommes de douche, fontaines) (OMS, 2007). La transmission se produit également dans les établissements de soins en raison d’une combinaison de facteurs de risque présents chez les résidents ou les patients et d’une conception et d’un entretien inadéquats de l’infrastructure du bâtiment (Silk et coll., 2013). L’infection de certaines espèces se produit par contact direct ou par aérosolisation de sols ou de compost contaminés (OMS, 2007; Picard-Masson et coll., 2016).

En tant que bactérie présente dans l’environnement, la Legionella est sensible aux facteurs climatiques. La légionellose montre une forte saisonnalité, avec une incidence plus élevée à la fin de l’été et au début de l’automne (Simmering et coll., 2017; Alarcon Falconi et coll., 2018). On observe également des différences régionales, qui peuvent être associées à des facteurs climatiques (Beauté et coll., 2016; Simmering et coll., 2017). L’association avec des facteurs climatiques la plus constante et la plus forte a été signalée entre la légionellose et les précipitations. Plusieurs études menées en Amérique du Nord, en Asie et en Europe ont révélé un accroissement du risque de légionellose sporadique à la suite de précipitations de pluie (Fisman et coll., 2005; Hicks et coll., 2007; Garcia-Vidal et coll., 2013). Le risque est plus grand de deux à onze jours après la pluie (Fisman et coll., 2005; Chen et coll., 2014b; Beauté et coll., 2016;) et suit un rapport de multiplication de 2,5 à 2,6 fois l’incidence pour chaque 5 mm à 1 cm de pluie (Hicks et coll., 2007; (Chen et coll., 2014b) ou de 2,1 à 2,5 fois comparativement aux périodes sans pluie (Fisman et coll., 2005; Beauté et coll., 2016). Cela peut s’expliquer par le fait que les précipitations peuvent augmenter le ruissellement qui entraîne des nutriments et des protozoaires dans les sources d’eau, ce qui peut accroître la réplication des bactéries Legionella en plus d’augmenter la turbidité et la quantité de matière organique et réduire ainsi l’efficacité de la désinfection de l’eau (Fisman et coll., 2005).

Dans les zones tempérées, on a également constaté que les températures plus chaudes augmentaient le risque de légionellose (Fisman et coll., 2005; Hicks et coll., 2007; Conza et coll., 2013; Halsby et coll., 2014; Beauté et coll., 2016; Simmering et coll., 2017). Une hausse de 1 °C a été associée à une augmentation du risque de 2,8 % à 7 % (Fisman et coll., 2005; Hicks et coll., 2007; Conza et coll., 2013), , et le risque survient après un décalage de trois à neuf semaines (Halsby et coll., 2014; Beauté et coll., 2016). Cependant, une étude (Beauté et coll., 2016) a montré que le risque pourrait diminuer à des températures plus élevées (supérieures à 20 °C). Enfin, une humidité relative et une pression de vapeur plus élevées ont été associées au risque de légionellose (Fisman et coll., 2005; Conza et coll., 2013; Gleason et coll., 2016; Simmering et coll., 2017). Une humidité plus élevée a été associée positivement aux cas de légionellose (Gleason et coll., 2016). Simmering et coll. (2017) ont révélé que la température et l’humidité interagissent; le risque le plus élevé se situait entre 16 °C et 27 °C, avec une humidité relative supérieure à 70 %. En résumé, le risque de légionellose semble augmenter après un temps plus chaud et plus humide (Chen et coll., 2014a; Halsby et coll., 2014), car les milieux chauds et humides favorisent la croissance des bactéries Legionella et son aérosolisation.

6.3.4.2 Infection à Cryptococcus gattii

Le Cryptococcus gattii est un champignon présent dans l’environnement qui peut infecter les humains ainsi que de nombreuses espèces animales (Chen et coll., 2014b). Il se trouve dans le sol et les débris d’arbres, mais il peut aussi se trouver dans l’air, l’eau douce et l’eau salée, de même que sur les véhicules et les fomites – des objets ou des matériaux comme des vêtements, des ustensiles et des meubles qui sont susceptibles de propager une infection (Kidd et coll., 2007a). Ses spores présentes au sol ou sur les arbres sont aérosolisées et transportées vers d’autres sites ou inhalées par les humains et les animaux (Kidd et coll., 2007b). Chez les humains, les spores inhalées se retrouvent dans les poumons où elles causent une pneumonie ou des nodules pulmonaires. Elles peuvent être transportées dans la circulation sanguine, en particulier vers le système nerveux central où elles causent une méningite ou des nodules cérébraux (Chen et coll., 2014b) (figure 6.7). Le taux de mortalité est élevé, à savoir 23 % (Phillips et coll., 2015). Les personnes les plus à risque d’infection comprennent les personnes âgées de plus de 50 ans, les fumeurs et les personnes atteintes d’une maladie pulmonaire chronique, de même que celles qui sont immunodéprimées ou qui suivent un traitement immunosuppresseur (MacDougall et coll., 2011).

Le Cryptococcus gattii est présent dans le monde entier. Il est apparu pour la première fois au Canada en 1999, sur l’île de Vancouver, lorsqu’il a causé une éclosion chez des animaux et des humains en bonne santé (Fyfe et coll., 2008). Depuis, son incidence a augmenté pour atteindre un état stable de 0,2 à 0,5 cas pour 100 000 habitants en Colombie-Britannique (BCCDC, 2019). Depuis 2004, le champignon est présent dans l’environnement et chez les humains et les animaux dans la partie continentale de la Colombie-Britannique et dans les États voisins de Washington et de l’Oregon (MacDougall et coll., 2007). On ne sait pas trop si l’aire de répartition du C. gattii s’est élargie ou s’il était déjà présent dans ces régions (Roe et coll., 2018). Très peu de cas canadiens acquis localement ont été signalés à l’extérieur de la Colombie-Britannique, à l’exception de deux cas chez l’humain au Québec en 2008 et en 2015 (St-Pierre et coll., 2018) et d’un cas dans un chevreuil en Nouvelle-Écosse en 2014 (Overy et coll., 2016).

En tant que champignon présent dans l’environnement, le C. gattii est sensible aux facteurs climatiques. L’humidité, la température, les précipitations, l’évaporation et le rayonnement solaire influent tous sur la présence du C. gattii dans l’environnement (Granados et Castañeda, 2006; Kidd et coll., 2007b). Un modèle de niche écologique utilisé en Colombie-Britannique décrit les zones dont les conditions environnementales favorisent l’établissement du C. gattii comme étant celles de faible altitude, ayant une température quotidienne moyenne supérieure à 0 °C en janvier, et situées dans deux zones climatiques côtières de la Colombie-Britannique où les hivers sont doux et humides et les étés sont chauds et secs (Mak et coll., 2010). Les données d’échantillonnage environnemental en Colombie-Britannique ont révélé que les concentrations du C. gattii dans les échantillons d’air étaient plus élevées durant les mois d’été, lorsque les conditions sont chaudes et sèches et que l’humidité relative est faible (Kidd et coll., 2007b).

La réaction aux facteurs climatiques et à d’autres facteurs environnementaux varie à l’échelle mondiale et peut dépendre en partie de l’endroit où l’on prélève des échantillons du C. gattii (c.-à-d. l’air, le sol ou les arbres), du type de souche et d’autres facteurs. Le vent augmente l’aérosolisation du sol et favorise la propagation (Uejio et coll., 2015). Les chutes de pluie abondantes ou l’humidité peuvent causer le dépôt des spores présentes dans l’air (Kidd et coll., 2007b), bien que, dans la plupart des régions, le C. gattii soit plus susceptible d’être isolé des arbres pendant la saison des pluies, ce qui porte à croire qu’il est plus abondant à ce moment-là (Uejio et coll., 2015). En Colombie-Britannique, la quantité de C. gattii isolé à partir des arbres et sa concentration dans le sol sont plus faibles lorsque les températures sont plus élevées, mais dans d’autres parties du monde, la fréquence d’isolement était la plus forte à des températures très élevées (Uejio et coll., 2015). Les spores de C. gattii peuvent résister à un fort rayonnement solaire, de sorte qu’il est peu probable que les conditions estivales avec des températures élevées et un taux d’isolement élevé empêchent le C. gattii de survivre (Rosas et Casadevall, 2006).

6.3.4.3 Blastomycose

Le Blastomyces dermatitidis est un champignon dimorphique présent dans le sol humide et la végétation en décomposition. La transmission se produit de l’environnement aux humains et aux autres animaux par aérosolisation et inhalation (Castillo et coll., 2016). Les spores inhalées dans les poumons causent une blastomycose pulmonaire caractérisée par la toux, la fièvre et l’essoufflement (McBride et coll., 2017). La levure peut être transportée par le sang vers d’autres organes et l’infection cutanée peut se produire par inoculation directe (Castillo et coll., 2016). Le taux de mortalité est élevé (entre 5 % et 20 %), probablement en raison d’un diagnostic tardif, en particulier dans les régions moins endémiques (Crampton et coll., 2002; Dalcin et Ahmed, 2015). L’infection est traitée avec des antifongiques (Castillo et coll., 2016). La période d’incubation est habituellement d’un à trois mois, et les cas surviennent principalement chez les personnes immunodéprimées, les fumeurs et les personnes atteintes de maladies sous-jacentes qui présentent un risque plus élevé d’infection et de mortalité (Crampton et coll., 2002; Dalcin et Ahmed, 2015; Castillo et coll., 2016; McBride et coll., 2017). Les personnes sont plus à risque d’être exposées pendant les activités de plein air comme la chasse et le camping (Crampton et coll., 2002). La plupart des cas sont sporadiques, mais les activités qui perturbent le sol (p. ex., construction, déforestation, activités de plein air) et l’exposition aux berges de rivière ont été associées à des éclosions de sources ponctuelles (Baumgardner et Burdick, 1991; Proctor et coll., 2002; Azar et coll., 2015).

Le Blastomyces dermatitidis est endémique dans certaines régions du Canada, dont le sud de la Saskatchewan, le Manitoba, l’Ontario et le sud du Québec (Crampton et coll., 2002; Litvinov et coll., 2013; Lohrenz et coll., 2018). La blastomycose n’est à déclaration obligatoire qu’en Ontario et au Manitoba et peut être sous-estimée dans d’autres régions du pays. Il est hyperendémique dans le nord-ouest de l’Ontario, caractérisé par des taux élevés et persistants de maladie. La région de Kenora a les taux les plus élevés déclarés dans le monde, avec 35 hospitalisations par 100 000 habitants par année dans le nord-ouest de l’Ontario (Litvinjenko et Lunny, 2017; Brown et coll., 2018). Cette région endémique est contiguë aux régions endémiques des États américains qui bordent les rivières Mississippi et Ohio, les Grands Lacs et la voie maritime du Saint-Laurent (McBride et coll., 2017).

Le Blastomyces est un mycète présent dans l’environnement; sa croissance et sa dispersion dépendent donc des conditions climatiques. Les facteurs écologiques particuliers sont mal compris en partie parce que l’organisme a rarement été récupéré de l’environnement, mais le sol humide près des cours d’eau et des lacs semble être la niche privilégiée des mycètes de l’espèce Blastomyces (Castillo et coll., 2016). La perturbation du sol facilite l’aérosolisation (Baumgardner, 1997). On suppose que la proximité des cours d’eau et la sécheresse suivie d’une augmentation des précipitations peuvent contribuer à l’exposition des spores et faciliter leur dispersion (McDonough et coll., 1976; McTaggart et coll., 2016). Bien que le pic d’apparition de l’infection pulmonaire se situe à l’automne et à l’hiver, en raison de l’exposition pendant le temps plus chaud (Morris et coll., 2006; Light et coll., 2008; Dalcin et Ahmed, 2015; Brown et coll., 2018), peu d’études ont évalué expressément le rôle des facteurs climatiques, et des résultats variables ont été rapportés. Baumgardner et coll. (2011) ont noté un lien entre les précipitations totales, la température (températures moyennes basses pendant la saison de l’infection, mais températures maximales élevées la saison précédente) et les cas chez les canidés. Seitz et coll. (2015) ont relevé un risque plus élevé d’hospitalisations pour blastomycose lorsque la température maximale est plus basse. Proctor et coll. (2002) ont enquêté sur une éclosion qui a suivi une période de sécheresse prolongée. De même, Pfister et coll. (2011) ont déterminé qu’une sécheresse modérée à grave, suivie de précipitations supérieures à la normale et d’un réchauffement des déchets de jardin ont été associés à une éclosion au Wisconsin. Le vent peut être un facteur, car certaines éclosions ont été associées à la poussière d’excavation (Baumgardner et coll., 2011) ou à la perturbation des déchets de jardin en décomposition (Pfister et coll., 2011). Un modèle de niche écologique du Wisconsin a révélé que l’indice de végétation estivale et la proximité des voies navigables étaient les meilleurs facteurs prédictifs de l’emplacement des cas de blastomycose humaine et animale, et que les facteurs bioclimatiques ne jouaient pas un rôle important (Reed et coll., 2008).

6.3.4.4 Histoplasmose

L’histoplasmose est causée par le champignon dimorphique Histoplasma capsulatum. Les spores prolifèrent dans un sol humide riche en guano de chauves-souris ou d’oiseaux le long des cours d’eau et dans les grottes. La perturbation du sol attribuable aux travaux d’excavation et de construction entraîne la production d’aérosols et un risque d’inhalation de spores. L’infection se développe de 7 à 14 jours après l’exposition. Elle est souvent asymptomatique ou cause des maladies spontanément résolutives avec fièvre, maux de tête, faiblesse, douleurs thoraciques et toux. Elle peut engendrer une infection extrapulmonaire et aussi causer une infection pulmonaire plus grave chez les personnes atteintes de maladies pulmonaires sous-jacentes ou immunodéprimées (Kauffman, 2007). L’Histoplasma capsulatum est endémique le long des bassins hydrographiques du Saint-Laurent et des Grands Lacs au Québec et en Ontario, dans les vallées de l’Ohio et du Mississippi aux États-Unis, et le long des voies navigables en Asie et en Amérique du Sud. Au Canada, c’est au Québec que l’on note le taux le plus élevé de maladies diagnostiquées. Dans une étude, on a recensé 58 cas au Canada sur une période de trois ans (de 1992 à 1994), 72 % ayant été signalés au Québec (Nicolle et coll., 1998). Des cas en Alberta ont été recensés pour la première fois en 2003, et depuis, on en signale quelques-uns chaque année (Anderson et coll., 2006; Alberta Health, 2018). Le champignon est sensible au climat, préférant des températures modérées (de 18 °C à 28 °C), une humidité constante et une faible lumière (Teixeira, 2016).

6.3.4.5 Coccidioïdomycose

La coccidioïdomycose est causée par les mycètes de l’espèce Coccidioides que l’on trouve dans le sol aride, y compris le C. immitis en Californie et le C. posadasii ailleurs (Maves et Crum-Cianflone, 2012). Les spores sont libérées dans l’air lorsque le sol est perturbé et peuvent être inhalées par les humains, causant la coccidioïdomycose, aussi connue sous le nom de fièvre de la vallée. La maladie a une période d’incubation d’une à trois semaines, et de nombreuses personnes demeurent asymptomatiques ou ne présentent que de légers symptômes. Environ 40 % développent une infection pulmonaire accompagnée de toux, de douleurs thoraciques, de dyspnée et de fièvre. Cette situation est habituellement spontanément résolutive et la personne guérit en quelques semaines. L’infection disséminée se produit chez 5 % des personnes et entraîne une maladie pulmonaire diffuse et chronique, une méningite ou une infection dans d’autres organes (Maves et Crum-Cianflone, 2012). Cette forme grave nécessite un traitement antifongique prolongé. Les femmes enceintes et les personnes dont l’immunité cellulaire est affaiblie, comme en raison d’une séropositivité au VIH ou d’une transplantation d’organes, sont plus à risque de développer une maladie grave. La réactivation de la maladie latente est également possible (Maves et Crum-Cianflone, 2012). L’aire de répartition géographique du mycète comprend des régions de l’Amérique du Sud et de l’Amérique centrale, le Mexique et le sud-ouest des États-Unis (Maves et Crum-Cianflone, 2012). Certaines régions de la Californie et de l’Arizona affichent les taux les plus élevés au monde. La perturbation des sols, y compris la construction, les fouilles archéologiques, les tremblements de terre et les tempêtes de vent, dans les zones désertiques endémiques sont la principale source d’exposition (Maves et Crum-Cianflone, 2012).

Le Coccidioides spp. est affecté par des facteurs climatiques (Nguyen et coll., 2013); il a besoin d’humidité pour proliférer dans le sol, puis d’une période sèche pour produire des spores pouvant passer à l’état d’aérosol (l’hypothèse « croissance et dispersion ») (Comrie et Glueck, 2007). Le pic saisonnier des cas chez l’humain aux États-Unis se produit principalement à l’automne, après une période de mois pluvieux suivie de mois chauds et secs. On observe également une tendance cyclique avec des pics d’incidence environ tous les deux à cinq ans qui seraient associés à des sécheresses suivies de temps pluvieux (Park et coll., 2005; Tamerius et Comrie, 2011; Gorris et coll., 2018 ). Les températures plus chaudes sont associées à une incidence plus élevée chez les humains (Gorris et coll., 2018), et un accroissement de l’incidence est observé à la suite de grandes tempêtes de vent (Tong et coll., 2017). Cependant, l’incidence est faible dans les régions où les précipitations annuelles moyennes sont élevées ou où le sol est très humide (comme les régions côtières) (Gorris et coll., 2018).

6.4.1.1 Évaluations rapides et réactives du risque

Les évaluations rapides et réactives du risque sont des évaluations qualitatives du risque réalisées en réponse à un événement immédiat d’émergence d’une maladie au Canada, ou à un risque perçu, comme un événement ou une menace de maladie internationale, qui nécessite une prise de décision rapide. Elles sont élaborées à l’aide de la littérature scientifique et des connaissances sur une maladie au moment où la maladie émerge ou réapparaît; elles peuvent être mises à jour à mesure que l’on en sait davantage au sujet de l’événement d’émergence de la maladie. Elles précèdent généralement la mise en œuvre des activités de surveillance et d’intervention et visent à les orienter. Les exemples comprennent celles menées en réponse à la menace du virus Zika au Canada aux échelles nationale (gouvernement du Canada, 2016) et provinciale (INSPQ, 2016), de même que celles qui ont été élaborées par le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) en réponse à un certain nombre d’événements d’émergence de maladies (ECDC, 2019). L’Organisation mondiale de la Santé a élaboré un protocole pour la préparation liée à ces évaluations (OMS, 2019e) au Canada. Il est essentiel que les responsables canadiens de la santé publique puissent effectuer des évaluations rapides et réactives des risques pour pouvoir intervenir en cas d’éclosion, y compris celles causées par les changements climatiques.

6.4.1.2 Prévision des populations à risque futures et élaboration d’alerte précoce au moyen d’évaluations quantitatives des risques fondées sur des modèles

Les évaluations quantitatives des risques visent à prédire où et quand les maladies infectieuses peuvent émerger ou réapparaître avec une précision utile aux responsables de la santé publique afin qu’ils puissent adopter les politiques et programmes nécessaires pour se préparer et intervenir face à l’émergence de maladies. Les évaluations des risques peuvent utiliser des modèles mathématiques qui recréent les composantes essentielles des cycles de vie des vecteurs ou des cycles de transmission des maladies, s’il y a suffisamment de données quantitatives pour calibrer ces types de modèles. Sinon, des modèles de niche statistique ou écologique peuvent être utilisés, à condition qu’il y ait des données de surveillance comprenant à tout le moins des renseignements sur la présence, mais préférablement des données sur la présence, l’absence et l’abondance pour les calibrer. Dans un cas comme dans l’autre, l’objectif des modèles est d’évaluer où et quand le risque de maladies infectieuses sensibles au climat peut changer (c.-à-d. qu’ils fournissent une « alerte précoce » des risques futurs de maladie). Les modèles prédictifs sont utilisés à trois fins principales (Ogden et Gachon, 2019) :

• la prévision à court terme des risques de maladie en fonction des conditions météorologiques;
• les prévisions à long terme ou saisonnières fondées sur le climat;
• les projections des effets à long terme des changements climatiques sur les risques de maladie.

Les modèles sont élaborés en établissant d’abord les associations clés entre la présence de vecteurs ou d’agents pathogènes et les conditions météorologiques (pour les prévisions à court terme) ou les variables climatiques, tout en tenant compte d’importants déterminants de leur présence non liés au climat qui peuvent comprendre d’autres changements environnementaux tels que le changement dans l’aménagement du territoire (Patz et coll., 2003). La validation des associations déduites par rapport aux données réelles est importante pour donner confiance dans l’utilisation des produits du modèle. Une fois que les associations entre le climat et la présence d’agents pathogènes/vecteurs ont été établies et quantifiées, il est possible d’évaluer les impacts des changements climatiques anticipés, obtenus à partir de modèles climatiques régionaux et mondiaux, sur la répartition d’agents pathogènes/vecteurs et les risques connexes.

Les prévisions fournissent une alerte précoce des éclosions de maladies causées par les conditions météorologiques. Cela peut comprendre des prévisions à court terme s’échelonnant sur quelques jours ou semaines et des prévisions à long terme s’échelonnant sur plusieurs mois qui peuvent être utilisées pour mettre en œuvre des activités de prévention et d’intervention (Morin et coll., 2018). Les évaluations fondées sur des modèles des effets des changements climatiques fournissent des évaluations de l’endroit et du moment où les événements d’émergence et de réémergence de maladies pourraient se produire dans les décennies à venir, et sont utilisées dans un certain nombre de contextes (Ogden et coll., 2014c), dont :

• la prise de décisions stratégiques nationales de haut niveau sur la nécessité pour la santé publique de se préparer à de nouveaux risques (Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique, 2017);
• les évaluations provinciales, territoriales et municipales de la vulnérabilité aux impacts des changements climatiques sur la santé et des mesures d’adaptation nécessaires (Berry et coll., 2014b);
• la conception et la mise en œuvre de la surveillance (Ogden et coll., 2014).

Comme nous l’avons vu plus haut dans le présent chapitre, un certain nombre d’évaluations des risques fondées sur des modèles ont été réalisées pour le Canada, y compris pour la maladie de Lyme (Ogden et coll., 2006; Ogden et coll., 2014)), la fièvre récurrente (Sage et coll., 2017), les tiques vectrices de Dermacentor variabilis (Minigan et coll., 2018), des maladies exotiques transmises par les moustiques et leurs vecteurs (Ogden et coll., 2014a; Ng et coll., 2017), et le virus du Nil occidental (Hongoh et coll., 2012; Chen et coll., 2013).

Depuis que Charron et coll. (2008) et l’OMS (OMS, 2019g) ont déterminé qu’il s’agissait d’un besoin méthodologique important, un certain nombre de méthodes d’analyse décisionnelle multicritères (ADMC) ont été explorées afin d’établir l’ordre de priorité des maladies à étudier en fonction de leur importance sur le plan de la santé publique, y compris leur risque d’émergence ou de réémergence en raison des changements climatiques (Ng et Sargeant, 2012; Cox et coll., 2013). Ces types de méthodes ont été adoptés et parfois adaptés pour l’établissement des priorités en matière de maladies aux échelons fédéral et provincial (INSPQ, 2018b), mais pas encore par toutes les administrations canadiennes.

Deux types de surveillance sont utilisés pour déceler les maladies infectieuses émergentes afin d’éclairer la gestion des éclosions. Le premier est la vigilance à l’égard des événements d’émergence de maladies à l’échelle internationale, et le deuxième, la surveillance propre à une maladie qui est mise en œuvre une fois qu’une maladie est reconnue comme présentant un risque important pour la santé publique de la population canadienne. L’impact possible des changements climatiques sur l’augmentation des événements d’émergence et de réémergence des maladies infectieuses à l’échelle internationale, et sur la dispersion croissante des agents pathogènes par les voyages, le commerce et la migration, accroît la nécessité d’une vigilance efficace à l’égard des maladies infectieuses émergentes dans d’autres pays. Les efforts internationaux qui soutiennent ce type de surveillance comprennent le RSI, aux termes duquel tous les États membres de l’OMS sont tenus de surveiller les événements d’émergence de maladies et de signaler tout cas repéré. En outre, dans le cadre de l’initiative mondiale « Un monde, une santé » (ou « Une seule santé »), l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture, l’Organisation mondiale de la santé animale et l’OMS collaborent au Système mondial d’alerte précoce, qui est un système d’alerte pour les menaces de maladies émergentes à l’interface homme-animal-écosystèmes. Les programmes internationaux de surveillance « passive » comprennent le réseau de surveillance GeoSentinel, un réseau international de cliniques médicales qui participent sur une base volontaire, et des systèmes de surveillance qui examinent le contenu Web accessible au public pour détecter les signaux de menaces émergentes potentielles. Il s’agit notamment du Program for Monitoring Emerging Diseases (ProMED), de HealthMap et de Medisys, de même que du Réseau mondial d’information sur la santé publique (RMISP) mis sur pied par l’ASPC (Ogden et coll., 2017).

Au Canada, un certain nombre de méthodes sont disponibles et sont utilisées pour assurer la surveillance des maladies infectieuses endémiques et émergentes, afin de suivre les tendances au chapitre de leur incidence, de déterminer leur répartition spatiotemporelle et la propagation des cas (y compris les grappes) et de définir les facteurs de risque au sein de la population touchée. La méthode normalisée pour obtenir des données sur les cas de maladies humaines à l’échelle nationale est le Système canadien de surveillance des maladies à déclaration obligatoire (SCSMDO) coordonné par l’ASPC (gouvernement du Canada, 2019e). Certaines maladies qui ne sont pas à déclaration obligatoire à l’échelle nationale peuvent l’être aux échelons provincial ou territorial. Ces maladies à déclaration obligatoire sont repérées à l’aide de critères de définition de cas cliniques et de laboratoire, notamment l’émergence ou la réémergence (à l’échelon national ou international). Parmi les autres critères pour l’ajout des maladies à la liste, mentionnons les maladies sous surveillance internationale, l’incidence au Canada, la gravité, la transmissibilité, la possibilité d’éclosions, le fardeau socioéconomique, la capacité de prévention, la perception du risque et la nécessité d’intervention de la santé publique (Agence de la santé publique du Canada, 2009).

D’autres méthodes de collecte d’information sur les cas possibles de maladies humaines pendant les événements d’émergence comprennent la surveillance syndromique, par exemple, l’utilisation de données en temps réel des pharmacies sur les ventes de remèdes contre la grippe pour suivre l’évolution de la pandémie de grippe H1N1 au Canada en 2009 (Muchaal et coll., 2015). Une autre méthode est la surveillance passive en laboratoire. En réponse à l’accroissement possible des risques posés par les arbovirus au Canada, le Laboratoire national de microbiologie de l’ASPC a mis en place une surveillance des cas humains d’infection par un arbovirus autre que le VNO en procédant régulièrement au dépistage d’un panel d’arbovirus endémiques et exotiques dans les échantillons de sérum prélevés aux fins de dépistage du VNO qui se sont avérés négatifs pour celui-ci (Drebot, 2015). Le Réseau pancanadien de santé publique a la capacité d’instaurer une surveillance nationale des cas humains pendant des périodes limitées lors d’événements d’émergence de maladies. Ce fut le cas récemment en réponse à la pandémie de COVID-19 et à l’éclosion du virus Zika en Amérique centrale et en Amérique du Sud en 2015-2016, qui a infecté plus de 500 voyageurs canadiens (gouvernement du Canada, 2019f).

Beaucoup d’efforts ont été déployés au Canada pour utiliser la surveillance sentinelle des animaux et des vecteurs afin de détecter les risques liés aux zoonoses à transmission vectorielle émergentes, en particulier le VNO, la maladie de Lyme et d’autres agents pathogènes transmis par l’Ixodes spp. comme méthode d’alerte précoce de la propagation des maladies émergentes et, dans le cas du VNO, des éclosions imminentes (Thomas-Bachli et coll., 2015). Quant aux maladies à transmission vectorielle, la surveillance des vecteurs comprend une surveillance active pour capturer les moustiques vecteurs, qui sont ensuite analysés pour savoir s’ils sont porteurs d’agents pathogènes à transmission par les moustiques, en particulier le VNO. Ce type de surveillance est réalisé couramment dans de nombreuses administrations au Canada (gouvernement du Canada, 2019a). Elle comprend également la collecte de tiques par échantillonnage par filet traînant, la capture d’hôtes de tiques et les analyses de tiques et de leurs hôtes pour détecter la présence d’agents pathogènes transmis par les tiques (Ogden et coll., 2014). La surveillance passive des tiques, qui englobe la présentation de tiques par les patients de cliniques médicales et vétérinaires, est une activité de surveillance clé au Canada, fournissant un ensemble de données particulièrement important qui vient étayer l’attribution de l’expansion de l’aire de répartition de I. scapularis au Canada aux impacts des changements climatiques (Leighton et coll., 2012).

Tant pour les moustiques que les tiques, la surveillance des vecteurs permet de capturer de multiples espèces de vecteurs et d’agents pathogènes. La surveillance des moustiques pour détecter le VNO a permis d’identifier des incursions d’Aedes spp. exotiques dans le sud de l’Ontario, qui sont les vecteurs du virus de la dengue et du virus Zika (unité sanitaire du comté de Windsor-Essex, 2019a, unité sanitaire du comté de Windsor-Essex, 2019b). La surveillance des tiques est principalement assurée par deux méthodes : la surveillance passive, qui consiste à analyser les tiques que les membres du grand public ont retirées sur eux-mêmes ou sur leurs animaux de compagnie et ont soumises par l’intermédiaire des cabinets vétérinaires et médicaux participants; et la surveillance active, qui consiste à recueillir des tiques à la recherche d’un hôte en traînant une flanelle sur le sol (échantillonnage par filet traînant) ou en examinant les rongeurs sauvages capturés (Ogden et coll., 2014c). Ces formes de surveillance des tiques ont été conçues à l’origine pour cerner le risque de la maladie de Lyme, mais elles sont capables de détecter le risque d’autres espèces de vecteurs de maladie (Gabriele-Rivet et coll., 2015; Nelder et coll., 2019). Les tiques recueillies dans le cadre des activités de surveillance font l’objet d’un dépistage de routine ciblant un large éventail d’agents pathogènes, en plus de la bactérie causant la maladie de Lyme (Dibernardo et coll., 2014). Au Canada, l’espèce à laquelle appartiennent la plupart des tiques recueillies au moyen de la surveillance est actuellement déterminée dans des laboratoires provinciaux, puis la tique est analysée pour détecter la présence d’agents pathogènes au Laboratoire national de microbiologie. Toutefois, cette méthode ne sera pas viable une fois que les tiques seront plus répandues, compte tenu de la forte augmentation prévue et observée (Gasmi et coll., 2018) du nombre de présentations de tiques au Canada. Il faut adopter des systèmes de surveillance nouveaux et nécessitant moins de ressources pour protéger la population canadienne contre l’accroissement des risques liés à ces maladies.

Un projet de science citoyenne appelé eTick a été lancé en 2014. Il s’agit d’une plateforme Web qui permet aux membres du grand public de soumettre des images de tiques aux fins d’identification de l’espèce par un entomologiste (eTick, 2019). Ce projet élargit considérablement la couverture géographique potentielle de la surveillance des tiques, en plus de donner l’occasion de fournir rapidement des renseignements sur la santé publique directement à la population exposée aux tiques. Il permet d’assurer une surveillance en temps réel de diverses espèces de tiques et de cartographier les lieux où elles sont observées, y compris les changements de répartition. Le programme est actuellement offert au Québec, en Ontario et au Nouveau-Brunswick. Au Manitoba, un système d’identification par image appelé Tick Checker, semblable à eTick, a été mis en œuvre en 2017 (gouvernement du Manitoba, 2019a). Cet effort s’inscrit dans le cadre du programme de surveillance passive des tiques à pattes noires du Manitoba, qui vise à cerner les endroits où de nouvelles populations de tiques et le risque de maladie de Lyme pourraient émerger, avant que ce ne soit confirmé par la surveillance active des tiques (gouvernement du Manitoba, 2018).

Les organismes de santé du bétail, comme l’Agence canadienne d’inspection des aliments, assurent le suivi de certaines zoonoses chez les animaux sentinelles lorsqu’elles relèvent de leur mandat, par exemple, le VEEE chez les chevaux (gouvernement du Canada, 2018c). Les organismes de santé de la faune, comme le Réseau canadien de la santé de la faune, aident à suivre certaines zoonoses d’origine faunique chez les animaux sentinelles (RCSF, 2019).

Les interventions internationales en cas d’éclosion de maladies infectieuses émergentes sont mandatées en application du RSI par l’intermédiaire du Réseau mondial d’alerte et d’action en cas d’épidémie (GOARN) [OMS, 2019d]. Ce réseau réunit des ressources techniques et opérationnelles d’institutions pertinentes dans les États membres de l’OMS, y compris des initiatives de surveillance, des réseaux de laboratoires, des organisations des Nations Unies (p. ex., UNICEF, HCNUR), la Croix-Rouge et des organisations humanitaires internationales non gouvernementales telles que Médecins sans frontières. Le réseau a la capacité de réunir et de déployer des équipes techniques dans les pays touchés par les éclosions afin d’aider à la coordination, à la gestion des maladies cliniques, à l’analyse épidémiologique ainsi qu’à la logistique et aux communications nécessaires pour lutter contre les éclosions. L’Agence de la santé publique du Canada dirige la vaste participation du Canada au GOARN. Elle a été créée en 2004, en partie pour assurer et améliorer la coordination nationale des interventions en cas de maladies infectieuses émergentes par l’intermédiaire du Réseau pancanadien de santé publique, et pour participer au RSI ainsi qu’au GOARN.

Le système de soins de santé et sa capacité à relever les cas de maladies humaines et de les traiter sont des moyens clés de réduire les risques pour la population canadienne en cas d’éclosion. Le diagnostic et le traitement des cas réduisent la transmission et contribuent à lutter contre les éclosions. Cependant, cela requiert de la vigilance de la part des travailleurs de la santé de première ligne; pendant certaines éclosions, les établissements de santé peuvent devenir un point de convergence pour la transmission, comme cela s’est produit pendant l’éclosion du SRAS au Canada (Varia et coll., 2003). L’accroissement de la résistance aux antimicrobiens et aux antiviraux remet en question la capacité des systèmes de soins de santé à traiter les maladies émergentes (OMS, 2019f).

La capacité technologique du Canada à prévenir et à contrôler les maladies infectieuses est bien avancée. Le Réseau fédéral-provincial-territorial des laboratoires de santé publique du Canada, appuyé par le Laboratoire national de microbiologie de l’ASPC, qui est l’une des sept installations de confinement de niveau 4 en Amérique du Nord, a la capacité de développer, d’améliorer et de mettre en œuvre des tests diagnostiques pour les maladies infectieuses émergentes telles que le virus Zika (Safronetz et coll., 2017). Le réseau mondial d’organisations de santé publique et d’entreprises pharmaceutiques est capable de mettre au point des vaccins en réponse aux éclosions (Carlsen et Glenton, 2016; Henao-Restrepo et coll., 2017). L’OMS a dressé une liste d’agents pathogènes prioritaires pour lesquels des vaccins sont nécessaires de toute urgence; plusieurs de ces maladies sont des zoonoses qui peuvent se propager de personne à personne, et le risque d’émergence peut être accru par les changements climatiques. Toutefois, le temps qu’il faut pour mettre au point des vaccins et pour en évaluer l’innocuité et l’efficacité afin d’assurer leur acceptabilité par le public (Carlsen et Glenton, 2016) souligne la nécessité de s’y prendre à l’avance plutôt que de simplement compter sur la mise au point de vaccins pour gérer les éclosions. Bien qu’il y ait une grande capacité de découverte de vaccins au Canada (Plummer et Jones, 2017), la pandémie de COVID-19 a mis en relief le manque de capacité de fabrication de vaccins au Canada.

D’autres adaptations technologiques sont importantes pour le contrôle actuel et futur des maladies à transmission vectorielle au Canada. Pour les maladies transmises par les moustiques comme le VNO, on a principalement recours aux méthodes de lutte contre les moustiques, qui sont efficaces. Elles consistent notamment à tuer les larves dans leur habitat aquatique (larvicide) à l’aide d’agents de lutte biologique non chimiques comme le Bacillus thuringiensis israelensis et à tuer les moustiques adultes (adulticide) au moyen de pulvérisations chimiques comme la deltaméthrine (Reisen et Brault, 2007). Dans le cas des maladies transmises par les tiques comme la maladie de Lyme, les méthodes de lutte contre les vecteurs, comme la pulvérisation d’acaricides à l’échelle de la région, ne sont pas homologuées et ne sont donc pas disponibles, ou en sont à un stade expérimental de développement au Canada (Ogden et coll., 2015). Les mesures de protection personnelle demeurent les mesures les plus efficaces pour lutter contre les maladies à transmission vectorielle, notamment les insectifuges, qui préviennent les morsures de tiques, les vêtements traités à l’insecticide (perméthrine) et l’élimination rapide des tiques qui se nourrissent sur le corps pour prévenir la transmission du B. burgdorferi (Ogden et coll., 2015). Pour que ces mesures soient efficaces, le public doit comprendre les risques, les percevoir comme méritant qu’on y donne suite, connaître les mesures de protection et être prêt à les prendre. Pour ce faire, il faut des communications efficaces de la part des organismes de santé publique à tous les niveaux, ce qui est de plus en plus difficile parce que la désinformation, surtout sur Internet, est un problème croissant (Greenberg et coll., 2017). En plus de communiquer de l’information sur la protection individuelle contre les maladies au Canada, il sera de plus en plus important de fournir des renseignements aux voyageurs. Cela aidera à prévenir l’introduction des infections à leur retour au Canada, en particulier des maladies exotiques à transmission vectorielle, qui pourraient être de plus en plus susceptibles d’être de transmission autochtone dans notre pays en raison des changements climatiques (Berrang-Ford et coll., 2009).

La vulnérabilité aux risques de maladies infectieuses liés aux changements climatiques est complexe et déterminée par un certain nombre de facteurs qui interagissent pour modifier l’exposition, la sensibilité et la capacité d’adaptation d’une personne. Bien que tous les Canadiens et les Canadiennes soient vulnérables aux changements climatiques, les impacts et les risques ne sont pas les mêmes pour tous, et certaines personnes et collectivités seront touchées de façon disproportionnée (voir le chapitre 9 : Changements climatiques et équité en santé). Les iniquités existantes en matière de santé et les variations de l’état des déterminants de la santé, combinées à l’exposition (p. ex., emplacement géographique) et aux facteurs génétiques et biologiques, peuvent accroître ou réduire la vulnérabilité aux changements climatiques. Il existe des lacunes au chapitre des connaissances concernant la combinaison de variables qui accroissent la vulnérabilité aux risques de maladies infectieuses liés aux changements climatiques. Cependant, on s’attend à ce que les personnes qui présentent des déterminants d’un mauvais état de santé (p. ex., faible revenu, logement non conforme aux normes, insécurité alimentaire) soient plus susceptibles de ressentir des impacts disproportionnés et d’avoir une capacité limitée à prendre des mesures de protection. Par exemple, en général, un mauvais état de santé est associé à un statut socioéconomique inférieur qui, à son tour, est associé à des taux plus élevés de comportements et d’habitudes alimentaires malsains (Hajizadeh et coll., 2016) engendrant des taux plus élevés de maladies chroniques (Roberts et coll., 2015) et pouvant accroître les risques sanitaires associés aux impacts des changements climatiques sur les maladies infectieuses.

Au Canada, les Premières Nations, les Inuits et les Métis doivent composer avec des iniquités systémiques et persistantes en santé, qui sont associées à un héritage de colonialisme et de traumatisme intergénérationnel (ASPC, 2019). Ils présentent des taux de maladies infectieuses nettement plus élevés que les populations non autochtones, ce qui, par le fait même, accroît les risques de maladies infectieuses liées aux changements climatiques (Adekoya et coll., 2015). Si une plus grande sensibilité aux maladies infectieuses, qui peut être due à des facteurs génétiques ou à des taux élevés de comorbidités chroniques (Badawi et coll., 2018), a été observée (p. ex., sensibilité génétique à la grippe H1N1), les iniquités existantes en santé, telles que la disponibilité et l’accessibilité limitées de services de soins de santé acceptables, les logements surpeuplés et le manque d’information culturellement pertinente sur la prévention des maladies (Centre national de collaboration de la santé autochtone, 2016), peuvent aggraver la vulnérabilité (voir le chapitre 9 : Changements climatiques et équité en santé). En outre, le risque d’exposition pourrait aussi être plus élevé pour les Premières Nations, les Inuits et les Métis en raison de leur forte dépendance sur les aliments traditionnels et les activités axées sur la terre telles que la chasse. Par exemple, des éclosions de trichinose ont été associées à la consommation de mammifères marins dans les régions arctiques (Yansouni et coll., 2016) et l’augmentation de l’abondance de moustiques, de tiques et d’autres insectes piqueurs qui peuvent transmettre de nouvelles maladies à transmission vectorielle est de plus en plus préoccupante (voir le chapitre 2 : Changements climatiques et santé des Autochtones du Canada). L’emplacement géographique peut également accroître l’exposition, par exemple, le risque d’exposition à la rage du renard arctique est plus élevé pour les collectivités de l’Arctique.

Les politiques visant à traiter ces causes sous-jacentes de vulnérabilité ne relèvent généralement pas du mandat des organismes de santé publique (Adler et Newman, 2002). Toutefois, il est de plus en plus reconnu dans le domaine de la santé publique que les changements climatiques exacerberont les iniquités en santé (Friel, 2019). Les efforts visant à renforcer les déterminants de la santé devraient être combinés aux activités liées aux changements climatiques et à la santé (p. ex., les mesures d’adaptation) (voir le chapitre 9 : Changements climatiques et équité en santé).

6.4.6.1 Lacunes en matière d’adaptation

L’établissement des priorités en matière d’options d’adaptation pour gérer les risques de maladies infectieuses liés aux changements climatiques au Canada devrait tenir compte de multiples critères, y compris : le niveau des risques et leur caractère immédiat; la viabilité technique des options; les ressources humaines et financières; la compatibilité avec les politiques actuelles; et d’autres contraintes (Ebi et coll., 2006a; Ebi et coll., 2006b). Pour bon nombre des risques de maladies infectieuses associés aux changements climatiques dont il est question dans le présent chapitre, la surveillance, le suivi et le contrôle des maladies ne seront efficaces que si des mesures locales sont prises. Il sera donc important de permettre aux systèmes locaux de santé publique et de soins de santé d’entreprendre ces activités pour accroître la résilience face à ces menaces. Un examen de la planification nationale de l’adaptation aux impacts des changements climatiques sur les maladies infectieuses dans 14 pays membres de l’Organisation de coopération et de développement économiques a révélé un certain nombre de limites à la planification actuelle. Ces limites comprenaient la prise en compte négligeable des besoins des groupes de population qui subissent des impacts disproportionnés, la participation limitée des administrations locales à l’évaluation des risques pour la santé et l’insuffisance de la logistique et du soutien liés au financement, aux échéanciers pour les évaluations et à l’élaboration de plans d’adaptation (Panic et Ford, 2013). Le rapport souligne que ces limites doivent être prises en compte dans les plans d’adaptation canadiens. L’évaluation post-pandémique des réponses de la santé publique canadienne face à la pandémie de COVID-19 sera probablement très instructive en ce qui concerne les lacunes actuelles en matière de capacité d’adaptation.

De plus, l’adaptation aux maladies infectieuses liées au climat est entravée par les lacunes actuelles en matière de recherche. Pour de nombreuses maladies infectieuses liées au climat, il y a un manque de connaissance de leur écologie, peu de données de surveillance pour l’étalonnage des modèles de niche statistique/écologique et pour la validation des modèles prédictifs, et une absence de surveillance à long terme qui est nécessaire pour attribuer les changements du risque lié à la maladie aux changements climatiques (Ebi et coll., 2017). Il est particulièrement difficile de lutter efficacement contre les maladies transmises par les tiques dans l’environnement, et des recherches s’imposent dans ce domaine. Les examens de la portée et les examens systématiques concernant les risques liés à des maladies à transmission vectorielle particulières établies comme étant prioritaires par les méthodes d’ADMC permettent de cerner les lacunes en matière de connaissances et de recherche (Otten et coll., 2019).

La capacité de lutter contre les vecteurs diminue à l’échelle mondiale en raison de la résistance accrue aux insecticides, ce qui représentera un défi important à relever pour protéger la santé de la population canadienne. Cependant, des techniques telles que l’introduction de moustiques génétiquement modifiés qui contrôlent les populations en produisant des rejetons non viables et de moustiques porteurs de la bactérie Wolbachia dans leurs intestins (les rendant ainsi incompétents en tant que vecteurs), font l’objet de recherches. Ces techniques pourraient être mises à la disposition des responsables de la santé publique dans un proche avenir.

6.4.6.2 Possibilités d’adaptation

Des renseignements existants sur l’écologie et l’épidémiologie des maladies à transmission vectorielle qui menacent la population canadienne (Corrin et coll., 2018), de même que sur les méthodes de prévention et de contrôle et leur efficacité (Hierlihy et coll., 2019) sont fournis aux responsables de la santé publique de tous les ordres de gouvernement afin de les aider à élaborer des plans d’intervention. L’augmentation prévue du comportement épidémique des maladies transmises par les moustiques, telles que le VNO et le VEEE, signifie que les prévisions du risque de maladie fondées sur les prévisions météorologiques recommandées par le GIEC seraient utiles pour les systèmes d’alerte précoce. Beaucoup de progrès ont été réalisés pour ce qui est de l’élaboration de méthodes de prédiction des éclosions de VNO selon les prévisions météorologiques, mais la mise en œuvre des programmes de santé publique du Canada nécessitera d’autres travaux (Ogden et coll., 2019).

La possibilité croissante de transmission autochtone de maladies exotiques représente un défi pour les activités de santé publique et le système de santé canadien. En raison de l’absence de maladies exotiques au Canada, les professionnels de la santé ne les envisageaient pas comme des diagnostics possibles chez des patients qui n’avaient pas d’antécédents de voyage dans des régions endémiques bien connues. Un renforcement de la modélisation des risques de maladie améliorera la préparation aux événements d’émergence de maladies, et une surveillance accrue des nouvelles maladies infectieuses non endémiques chez les patients qui demandent des soins serait prudente.

De même, une surveillance renforcée est nécessaire pour les maladies à transmission vectorielle qui sont actuellement exotiques en Amérique du Nord, mais qui risquent d’être transportées au Canada par des voyageurs; celles qui sont absentes du Canada, mais qui risquent de s’étendre vers le nord en provenance des États-Unis; et celles qui sont endémiques au Canada, mais qui peuvent réapparaître sous forme d’éclosions. L’éducation des fournisseurs de soins de santé au sujet de l’émergence possible de ces nouvelles maladies au Canada sera importante tant pour les personnes touchées, qui pourront bénéficier d’un diagnostic et d’un traitement précoces, que pour la détection précoce des éclosions par la santé publique. Les approches de surveillance citoyenne, comme le programme eTick (eTick, 2019), sont également une occasion de plus en plus reconnue. Ces approches pourraient également être améliorées en intégrant le savoir et l’observation autochtones (Tomaselli et coll., 2017; Henri et coll., 2018).

Il est possible d’utiliser des « mégadonnées » et des technologies telles que l’intelligence artificielle (IA) qui aident à analyser les mégadonnées pour être en mesure de composer avec les risques croissants pour la santé liés aux maladies infectieuses. La génomique moderne est la première source de mégadonnées qui à être utilisée dans cette optique. La surveillance des maladies entériques intègre maintenant le séquençage du génome entier (SGE) grâce au réseau PulseNet au Canada, ainsi qu’aux États-Unis et en Europe. PulseNet permet une détection plus sensible des grappes de cas et des éclosions, et une plus grande capacité pour attribuer de façon fiable les sources d’infection (Gilmour et coll., 2013). La quantité considérable de données générées par le SGE signifie que des méthodes d’analyse bioinformatique complexes ont dû être élaborées pour l’analyse rapide des données (IRIDA, 2019). L’application du SGE à d’autres logiciels de diagnostic et de surveillance des maladies infectieuses, de même que le développement plus poussé de l’épidémiologie moléculaire en vue d’utiliser pleinement les données, se poursuivront à l’avenir et appuieront des efforts plus robustes pour s’attaquer à ces risques. Les méthodes de métagénomique et de métacodage à barres, qui permettent de cerner l’éventail des espèces présentes dans les échantillons complexes d’espèces mixtes, se prêtent à une surveillance élargie des moustiques et des maladies transmises par les moustiques, y compris les moustiques et les agents pathogènes exotiques. Grâce à ces méthodes, il est possible d’identifier un éventail des espèces de moustiques et des agents pathogènes transmis par les moustiques capturés dans les pièges à moustiques pendant la surveillance des moustiques, plutôt que simplement le VNO. Ces méthodes pourraient également révolutionner la détection d’agents pathogènes dans d’autres échantillons d’ADN environnemental provenant de l’eau potable, de l’eau utilisée à des fins récréatives et du sol.

La deuxième source de mégadonnées provient des médias Web et des médias sociaux; ces données sont obtenues au moyen de méthodes de recherche sur le Web (Mukhi et coll., 2016). Cette source peut fournir des signaux précoces d’événements d’émergence de maladies afin d’améliorer les efforts de gestion d’organisations comme le RMISP. La troisième source de mégadonnées sont les données d’observation de la Terre obtenues par satellite. Elles fournissent des approximations pour les données environnementales comme les conditions météorologiques, le climat, les habitats et l’aménagement du territoire, qui peuvent être utilisées avec la modélisation des risques pour déterminer où les risques d’émergence et de réémergence de maladies sensibles aux facteurs environnementaux peuvent se produire (Ceccato et coll., 2018). Il existe de nombreux exemples de données d’observation de la Terre utilisées pour déterminer le risque de maladie (en particulier la maladie de Lyme) au Canada sous forme de cartes statiques des risques (figure 6.9). Les données d’observation de la Terre deviennent de plus en plus « volumineuses » en raison de l’augmentation du nombre et des types de satellites, la résolution spatiale des données étant de plus en plus précise. Dans un proche avenir, une plus grande fréquence d’images pourrait permettre de déterminer en temps réel les risques de maladies à transmission vectorielle comme le VNO. Du moins en théorie, les données d’observation de la Terre, synthétisées par modélisation des risques afin de produire de l’information sur les risques, pourraient remplacer la surveillance comme moyen de déclencher des interventions de santé publique bien avant que les cas de maladie n’apparaissent chez l’humain (Ogden et coll., 2019).

Beaucoup de travail a été fait pour déterminer et quantifier les effets des conditions météorologiques sur les moustiques vecteurs du VNO et sur le risque de transmission du VNO au Canada (voir la section 6.3.1.3 Maladies endémiques transmises par les moustiques au Canada), ce qui servirait de base à l’élaboration de prévisions sur les éclosions de VNO. La combinaison des données météorologiques et des données d’observation de la Terre sur l’habitat dans les modèles prédictifs des systèmes d’information géographique permettrait de faire des prévisions à haute résolution spatiotemporelle.

Bon nombre des défis posés par les nouveaux vecteurs et nouvelles maladies qui menacent la santé publique dans le contexte des changements climatiques sont communs à d’autres disciplines telles que l’agriculture (y compris la santé végétale et animale), la gestion de l’environnement et de la biodiversité, et les ressources naturelles qui devraient subir des invasions d’espèces (infectieuses ou autres) en raison des changements climatiques, entre autres facteurs. La collaboration en matière d’activités d’évaluation, de surveillance et de gestion des risques au moyen d’une approche « Un monde, une santé » (ou « Une seule santé ») robuste peut présenter des avantages importants par rapport à la gestion cloisonnée des risques propres au secteur (Ogden et coll., 2019). Cela nécessitera une collaboration plus systématique entre les disciplines et les ministères, qui sont tous confrontés à l’émergence de menaces pour la santé (humaine, animale et environnementale) associées aux changements climatiques.